SEBARAN RALSTONIA SOLANACEARUM PADA TOMAT BERDASARKAN KERAGAMAN GENETIK DI WILAYAH DAERAH ISTIMEWA YOGYAKARTA DAN PROVINSI JAWA TENGAH

ANA RUHANA SALAMAH, Prof. Dr. Ir. Triwidodo Arwiyanto; M.Sc, Prof. Dr. Ir. Achmadi Priyatmojo, M.Sc

2015 | Tesis | S2 Fitopatologi

Tomat (Lycopersicon esculentum Mill.) merupakan komoditas sayuran yang mempunyai nilai gizi tinggi terutama sebagai sumber vitamin A dan C. Tomat dapat ditanam mulai dari dataran rendah sampai dataran tinggi. Dalam budidaya tomat serangan bakteri penyebab layu Ralstonia solanacearum menjadi penghambat produksi. R. solanacearum merupakan bakteri penyebab layu yang sangat penting karena mempunyai kisaran inang yang sangat luas, sertamempunyai kemampuan bertahan hidup di dalam tanah dalam waktu yang lama. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui sebaran R. solanacearum berdasarkan keragaman genetik di Wilayah Daerah Istimewa Yogyakarta dan Provinsi Jawa Tengah. Isolat R. solanacearum dikoleksi dari pertanaman tomat dataran rendah Klaten, Jawa Tengah (200 mdpl), dataran sedang Pakem, Yogyakarta (410 mdpl) dan dataran tinggi Wonosobo, Jawa Tengah (1,400 mdpl). Morfologi koloni pada medium YPGA (Yeast Peptone Glucose Agar) berbentuk tidak beraturan, berwarna putih dan fluidal. Hasil pengujian kemampuan bakteri dalam menggunakan sumber karbon menunjukkan isolat bakteri yang dikoleksi dari datarn rendah dan dataran sedang termasuk dalam biovar III dan isolat dari dataran tinggi dua isolat masuk dalam biovar II (isolat W5 dan W11) dan isolat Wi dan W10 tidak masuk dalam kelompok biovar manapun. Hasil uji ras menunjukkan isolat mampu menginfeksi tomat, cabai, terung, kacang tanah, jahe dan tidak mampu menginfeksi pisang mas, pisang raja dan Heliconia sp. hal ini menunjukkan isolat termasuk dalam ras 1 kecuali untuk isolat Wonosobo (W5 dan W11) yang termasuk biovar II masuk dalam ras 3. Metode Filotipe Multiplex PCR digunakanuntuk mengetahui filotipe dari isolat yang didapatkan. hasil Filotipe Multiplex PCR menunjukkan semua isolat merupakan R. solanacearum yang ditunjukkan dengan adanya fragmen atau pita yang muncul pada 280 bp dan termasuk dalam filotipe I (Asia) yang ditunjukkan dengan adanya fragmen atau pita yang muncul pada 144 bp kecuali 2 (dua) isolat dari dataran tinggi Wonosobo (W5 dan W11) termasuk dalam filotipe II (Amerika).

Tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) is a vegetable with high nutritional value, especially as source of vitamin A and C. Tomato can be planted from lowlands to highlands. Bau in cultivation of tomato wilt attack caused by R.solanacearum is a barrier in the production of tomatoes. The aims of this study is to determine the distribution of R.solanacearum in tomato based on genetic diversity in Special Region of Yogyakartaand Central java Province. R. solanacearum isolates were collected from tomato cropping lowlands in Klaten, Central Java (200 m asl), Yogyakarta plains (410 m asl), and highlands of Wonosobo, Central Java (.400 m asl). Colony morphology of the isolates in YPGA medium was irregular shape, white colour and fluidal. The result of biovar test showed that R. solanacearum from the lowland and Yogyakarta plains belongs to biovar III and the isolates from highlands of wonosobo consist of two isolates (W5 and W11 isolates) belongs to biovar II and two other isolates (W1 and W10 isolates) can not be classified in any biovar group. The result of the pathogenecity test showed that isolates from lowlands and plains was able to cause wilt symptom in tomato, eggplant, chilli, peanut and ginger. The isolates were not able to cause wilt symptom in Heliconia sp and banana, its means that these isolates belong to race 1 except isolate from highland Wonosobo belong to race 3. Phylotipe Multiplex PCR, was conducted to figure out the phylotipe of these isolates. Result of the Phylotipe Multiplex PCR showed that all isolates are R. solanacearum indicated by the presence of the bands appear at 280 bp. All isolates classified as phylotipe I (Asia) showed by the bands at 144 bp except 2 (two) isolates from highlands of Wonosobo (W5 and W11 isolates) classified as phylotipe II (America).

Kata Kunci : Ralstonia solanacearum, tomat, layu bakteri