IDENTIFIKASI SECARA MORFOLOGI DAN MOLEKULER IKAN LAYUR (Trichiurus spp.) HASIL TANGKAPAN DI PERAIRAN PANTAI PANGANDARAN

TIA APRIANTI LESTARI, Dr. Eko Setyobudi, S.Pi., M.Si ; Dr. Ir. Murwantoko, M.Si.

2017 | Skripsi | S1 MANAJEMEN SUMBER DAYA PERIKANAN

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui spesies ikan layur (Trichiurus spp.) yang tertangkap di Perairan Pangandaran melalui identifikasi secara morfologi, serta membandingkannya dengan identifikasi secara molekuler. Sampel ikan layur diambil dari TPI Jongor Batu perairan Pantai Pangandaran pada bulan Maret-April 2017. Metode identifikasi morfologi melalui pengamatan secara langsung terhadap kenampakan morfologi ikan, serta didukung dengan pengukuran 22 karakter morfometrik yang dianalisis Principal Component Analysis (PCA) dan perhitungan 4 karakter meristik dibandingkan dengan pustaka. Identifikasi molekuler dilakukan dengan isolasi DNA, kemudian diamplifikasi dan sekuensing gen dengan target 16S rRNA. Ikan layur yang diamati memiliki jumlah sirip dorsal III.125-140 dengan letak sirip anal berada sejajar dengan jari- jari lemah sirip dorsal ke 38-41, sirip pektoral I.10, dan sirip anal I.91-I.112. Hasil dari PCA variasi morfologi terdapat pada bagian panjang tangkai ekor. Berdasarkan identifikasi morfologi spesies ikan layur yang tertangkap di perairan Pangandaran merupakan Trichiurus lepturus. Analisis molekuler menggunakan gen mitokondria 16S rRNA telah mengkonfirmasi hasil identifikasi secara morfologi bahwa spesies ikan layur yang tertangkap di Pangandaran adalah spesies Trichiurus lepturus yang memiliki kemiripan sebesar 98-99% dengan data GenBank. Analisis filogenetik menunjukan bahwa T. lepturus perairan Pangandaran berhubungan dekat dengan T. lepturus dari Kulon Progo, Bantul, dan Hainan China.

This aim of this study were to know the spesies of hairtail (Trichiurus spp.) caught in Pengandaran waters through morphological identification and to compare with molecular identification. Samples of fish were took from Jongor Batu Fish Auction Place in Pangandaran coastal waters during March-April 2017. The morphological identification was conducted by direct observation of fish morphology, then measure of 22 morphometric characters analyzed by Principal Component Analysis (PCA) and the calculation of 4 meristic characters compared with the literature. For molecular identification, DNA was isolated, then amplified and sequenced of 16S rRNA gene. Collection hairtails have III spines and 125 to 140 soft rays, anal fin situated below 38th to 41th dorsal-fin soft ray, pectoral fin with I spine and 10 soft rays, and anal fin with I spine and 91 to 112 spinules. The result of PCA morphology variation is presented in the caudal penducle length. Based on morphological identification the species of hairtal which caught in Pangandaran coastal waters is Trichiurus lepturus. Molecular analysis mitochondrial DNA of the partial 16S rRNA has confirmed the morphological identification that the hairtail caught from Pangandaran is Trichiurus lepturus with similarity 98-99% of GenBank. Phylogenetic analysis showed that T. lepturus from Pangandaran were closely related with Kulon Progo, Bantul, and Hainan China.

Kata Kunci : 16S rRNA, molekuler, morfologi, meristik, Trichiurus spp.