ANALISIS SIMILARITAS KARAKTER MORFOLOGIS DAN MOLEKULAR UDANG PISANG (Penaeus sp.) DENGAN SPESIES ANGGOTA FAMILIA PENAEIDAE DI PROVINSI ACEH

ZAHRATUL IDAMI, Dr. Niken Satuti Nur Handayani, M.Sc.

2016 | Tesis | S2 Biologi

Udang Pisang (Penaeus sp.) merupakan salah satu komoditas perikanan yang mulai dibudidaya di Provinsi Aceh. Udang Pisang memiliki keunggulan yaitu daya tahan yang lebih kuat terhadap penyakit dan pertumbuhan yang lebih cepat dibandingkan Penaeus monodon. Udang Pisang merupakan spesies baru yang perlu diidentifikasi dengan menggunakan data morfologis dan molekular. Data molekular menggunakan gen CO1 penting untuk menunjukkan identitas udang tersebut dalam Familia Penaeidae. Tujuan penelitian untuk mengetahui similaritas karakter morfologis, karakter molekular dan hubungan kekerabatan (filogenetik) Udang Pisang terhadap P. monodon, P. merguensis, dan Litopenaeus vannamei. Pengamatan morfologis sebanyak 84 sampai 90 karakter dianalisis dengan MVSP 3,1 terhadap spesimen jantan dan betina dengan UPGMA sebagai algoritme clustering dan koefisien Jacard. DNA udang diisolasi dari jaringan pleopoda, diamplifikasi dengan menggunakan primer CO1 (CrustF1 dan HCO2198) dan di sequencing. Sekuen DNA gen CO1 diBLAST, dilakukan alignment dengan ClustarX, analisis similaritas menggunakan Phydit, dan pohon filogenetik direkonstruksi dengan program MEGA 6 menggunakan metode Neighbor Joining (boostrap 1000). Udang Pisang memiliki similaritas karakter morfologis dengan P. monodon sebanyak 66-70 persen. Similaritas karakter morfologis Udang Pisang dengan P. merguensis dan L. vannamei secara berurutan yaitu 51 sampai 58 persen dan 39 sampai 40 persen. Sekuen DNA gen CO1 Udang Pisang memiliki kemiripan dengan P. monodon sebesar 92 persen. Sekuen DNA gen CO1 Udang Pisang dengan P. merguensis dan L. vannamei memiliki persentase nukleotida yang similar sebesar 86 persen dan 85 persen. Pohon filogenetik menunjukkan Udang Pisang berkerabat dekat dengan P. monodon dan bersifat monophyletic sedangkan dengan P. merguensis bersifat paraphyletic. Data molekular gen CO1 memperlihatkan kedudukan Udang Pisang sebagai anggota Familia Penaeidae, Genus Penaeus yang memiliki ancestor yang sama dengan P. monodon.

Banana shrimp (Penaeus sp.) is one of fisheries commodity that is cultivated in Aceh Province. Banana shrimp has a stronger resistance to disease and faster growth than Penaeus monodon. Banana shrimp is a new shrimp that need to identification using morphology and molecular data. Molecular data using CO1 gene is essential to indicate the identity of that shrimp in Penaeidae Family. This research aimed to determine the similarity of morphological character, molecular character and relationship (phylogenetic) Banana shrimp with P. monodon, P. merguensis, and Litopenaeus vannamei. Observation of morphological with 84 until 90 characters were analyzed using MVSP 3.1 against male and female specimens with UPGMA as clustering algorithms and Jacard coefficient. DNA of shrimp was isolated from pleopode tissue, amplified by using CO1 primer (CrusF1 and HCO2198) and DNA was sequencing. DNA sequence from CO1 gene must be BLAST first, did alignment with ClustarX, similarity analyse using Phydit, and phylogenetic tree had reconstructed with MEGA 6 by using Neighbor-joining method (boostrap 1000). Banana shrimp has similarity of morphological character with P. monodon is 66 until 70 percent. Similarity of morphological character from Banana shrimp with P. merguensis and L. vannamei as in series is 51 until 58 percent and 39 until 40 percent. DNA sequence using CO1 gene of Banana shrimp has similarity with P. monodon as many as 92 percent nucleotide. DNA sequence using CO1 gene of Banana shrimp with P. merguensis and L. vannamei has nucleotide percentage with is similar as many as 86 percent and 85 percent. The phylogenetic tree showed that Banana shrimp has a closely relationship with P. monodon and being monophyletic, whereas Banana shrimp with P. merguensis being paraphyletic. Molecular data using CO1 gene showed position of Banana shrimp as a member of Penaeidae Family and Genus of Penaeus, which has the same ancestor with P. monodon.

Kata Kunci : Penaeus, CO1, morfologis, dendogram, filogenetik/ Penaeus, CO1, morphology, dendogram, phylogenetic