IDENTIFIKASI MOLEKULER DAN DETEKSI GEN PENYANDI MIKOTOKSIN ISOLAT FUSARIUM SPP. DARI SAMPEL JAGUNG PASCAPANEN

KURNIA RITMA DHANTI, Ani Widiastuti, S. P., M.P., Ph.D ; Tri Joko, S.P., M. Sc., Ph.D

2016 | Tesis | S2 Bioteknologi

Fusarium merupakan salah satu jamur patogen yang banyak menginfeksi tanaman jagung dan dapat mengurangi kualitas maupun kuantitas produksi jagung. Selain itu, beberapa spesies Fusarium juga berpotensi menghasilkan senyawa mikotoksin yang berbahaya apabila dikonsumsi oleh manusia maupun hewan ternak. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi secara molekuler spesies Fusarium dari sampel biji jagung yang diambil dari 11 wilayah di Pulau Jawa dan 1 isolat dari Lombok Utara. Selain itu, dari isolat Fusarium yang telah berhasil diidentifikasi juga dilakukan deteksi gen penyandi senyawa mikotoksin untuk mengetahui potensi terbentuknya mikotoksin dari spesies tersebut. Identikasi spesies dan deteksi gen penyandi senyawa mikotoksin dilakukan dengan menggunakan primer-primer spesifik. Dari 24 isolat yang diidentifikasi, 14 isolat merupakan spesies F. verticillioides, 4 isolat merupakan spesies F. graminearum, 5 isolat merupakan spesies F. proliferatum dan 1 isolat merupakan spesies F. asiaticum. 2. Pada spesies F. graminearum terdeteksi gen penyandi deoxinivalenol dan zearalenon, pada F. verticillioides adalah terdeteksi gen penyandi fumonisin, deoxinivalenol dan zearalenon, serta pada F. asiaticum terdeteksi gen penyandi deoxinivalenol dan zearalenon. Sementara pada spesies F. proliferatum tidak terdeteksi gen penyandi mikotoksin.

Fusarium spp. is one of important pathogens that infect maize and decrease production of maize both in quality and quantity. Some species of Fusarium can also produce mycotoxins compound which are harmfull for human and animal health. The aims of this research were to identify Fusarium species based on molecular analysis and to detect the mycotoxin related gene to get information about the potency of those species in producing mycotoxins. Samples of maize kernels were collected from several regions in Java Island and also one from North Lombok. Molecular identification was conducted by PCR assay using specific primers. The results showed that from 24 isolates of Fusarium, there were 14 isolates of F. verticillioides, 4 isolates of F. graminearum, 5 isolates of F. proliferatum and 1 isolate of F. asiaticum identified. In both F. graminearum and F. asiaticum, deoxynivalenol and zearalenon related genes were detected. In F. verticillioides, fumonisin, deoxynivalenol and zearalenone related genes were detected, while in F. proliferatum, there was no mycotoxin related gene detected.

Kata Kunci : Fusarium spp., jagung, identifikasi molekuler, primer spesifik, mikotoksin / Fusarium spp., maize kernel, molecular identification, spesific primer, mycotoxin