ISOLASI DAN IDENTIFIKASI FUNGI PENGENDALI HAYATI Pratylenchus coffeae DARI RIZOSFER TANAMAN KOPI

NUR ISNAINI, Dr. Ir. Siwi Indarti, M.P. dan Dr. Tri Rini Nuringtyas, S.Si., M.Sc.

2016 | Tesis | S2 Biologi

Pratylenchus coffeae merupakan nematoda parasit penyebab utama penurunan produksi kopi di Indonesia. Kerugian yang disebabkan nematoda ini mencapai hingga 78%. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan isolat fungi pengendali hayati nematoda Pratylenchus coffeae dari tanah rizosfer tanaman kopi PT Perkebunan Nusantara XII Bondowoso, Jawa Timur. Uji patogenisitas in vitro dilakukan terhadap nematoda P. coffeae stadia campuran (larva dan dewasa) untuk mendapatkan lima isolat terbaik dari 58 isolat yang diperoleh. Isolat terpilih pada penelitian ini yaitu PIIIB0402b, PIVB0402a, PIIB0402b, PIVA0302b dan PIVA0402b. Uji kualitatif enzim ekstraselular protease dan kitinase serta uji toksisistas ekstrak kasar metabolit sekunder dilakukan untuk mengetahui mekanisme antagonistik isolat fungi terpilih. Berdasarkan serangkaian uji yang dilakukan, isolat fungi PIIIB0402b mempunyai kemampuan mekanisme antagonis utama dengan menghasilkan enzim protease dan metabolit sekunder, sedangkan isolat PIVB0402a mempunyai kemampuan mekanisme utama secara mekanik yang didukung oleh kemampuan menghasilkan enzim protease dan metabolit sekunder. Ketiga isolat lainnya PIIB0402b, PIVA0302b dan PIVA0402b mempunyai mekanisme antagonistik gabungan secara mekanik, enzimatik dan metabolit sekunder. Hasil identifikasi isolat fungi menggunakan karakter fenotipik dan analisis menggunakan marker molekular daerah ITS rDNA diketahui keempat isolat merupakan spesies anggota Penicillium dan satu isolat belum teridentifikasi sampai level genus tetapi diduga sebagai anggota Askomikota. Isolat PIIIB0402b dan PIVB0402a diketahui merupakan isolat yang paling berpotensi untuk dikembangkan sebagai agens pengendali hayati dari lima isolat terpilih. Kedua isolat tersebut mampu menyebabkan kematian nematoda dengan peringkat tertinngi yaitu 77,5% dan 67%.

Pratylenchus coffeae is a plant-parasitic nematode caused a major decline of coffee crop yield in Indonesia. The loss caused by P. coffeae is up to 78%. The aim of this research was to obtain fungal isolates as a biological control agent against P. coffeae from rhizosphere soil of coffee plantation in PT Perkebunan Nusantara XII Bondowoso, Jawa Timur. In vitro pathogenic test in vitro was done to mixed stadia of P. coffeae (J2, J3, J4 and adult) to screen the five best isolates from the total of 58 fungal isolates. These isolates were coded as PIIIB0402b, PIVB0402a, PIIB0402b, PIVA0302b and PIVA0402b. Qualitative test of extracellular enzyme for protease and chitins and toxicity test for crude extract of secondary metabolite were done to recognize the antagonistic mechanism among the chosen fungal isolates. The results showed that PIIIB0402b produced protease enzyme and secondary metabolite; while isolate PIVB0402a possed mechanical mechanism supported by the ability to produce protease enzyme and secondary metabolite. Based on the result of identification using phenotypic characters and analysis of molecular marker on ITS rDNA region, it is known that four isolates belong to species of Penicillium genus and one isolate is suspected as Ascomycetes member. Isolate PIIIB0402b and PIVB0402a known as the most potential as biological control agents among others. Both isolates were PIIIB0402b and PIVB0402a caused high mortal of nematodes by 77,5% and 67%, respectively.

Kata Kunci : Tanaman kopi, pengendali hayati, fungi, Pratylenchus coffeae / Coffee crops, biological control, fungi, Pratylenchus coffeae