Isolasi dan Identifikasi Molekuler Marine Yeast sebagai Kandidat Probiotik pada Ikan Kerapu Cantang

ARIF BIMANTARA, Dr. Ir. Murwantoko, M.S.i. ; Noer Kasanah, Apt., M.Si., Ph.D.

2016 | Tesis | S2 Bioteknologi

Kerapu cantang merupakan salah satu komoditas perikanan unggulan baru di Indonesia. Biaya pakan yang tinggi menjadi salah satu masalah yang dihadapi pada usaha budidaya ikan termasuk kerapu cantang. Probiotik yeast merupakan salah satu solusi untuk masalah tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi marine yeast sebagai kandidat probiotik pada ikan kerapu cantang. Yeast diisolasi dari usus kerapu lumpur (Epinephelus coioides). Identifikasi molekuler dilakukan dengan analisis sekuen 18s rDNA dan ITS (internal transcribed spacer) rDNA. Seleksi untuk menentukan isolat yang akan diberikan pada ikan dilakukan dengan menguji aktivitas enzim pencernaan alfa amilase, protease dan lipase yeast. Kultur cair yeast dengan kepadatan 7 x 10 pangkat 7 CFU/ml diberikan pada kerapu cantang secara oral sebanyak 100 mikroliter .Uji viabilitas dilakukan dengan re-isolasi yeast dari usus kerapu cantang dan amplifikasi sekuen ITS rDNA dengan primer spesifik. Sembilan isolat yeast digunakan dalam penelitian ini, 4 isolat hasil isolasi dari usus kerapu lumpur dan 5 isolat merupakan koleksi laboratorium. Hasil identifikasi molekuler dari 9 isolat yeast didapatkan 5 spesies berbeda. Dua jenis yeast hasil seleksi yaitu Lodderomyces elongisporus dan Candida orthopsilosis positif memiliki aktivitas enzim pencernaan alfa amilase. Hasil uji pemberian yeast pada kerapu cantang menunjukkan bahwa L. elongisporus tidak mampu hidup di dalam saluran pencernaan. C. orthopsilosis mampu hidup di dalam saluran pencernaan hingga hari ke-9 pengamatan. C. orthopsilosis tidak berpotensi menjadi kandidat probiotik karena tidak mampu memberikan efek positif pada aktivitas enzim pencernaan kerapu cantang serta kemungkinan sifat patogen pada jenis yeast tersebut.

Cantang grouper is one of the new prime commodities in Indonesia. High feed cost is one of the problems faced in aquaculture industry, including for cantang grouper fish. Yeast as a probiotic is among the solutions for such problem. This study is aimed to determine the effect of yeast application to digestive enzymes activity in cantang grouper. Yeast was isolated from the intestines of orange-spotted grouper (Epinephelus coioides). Molecular identification was performed by 18s rDNA and ITS (internal transcribed spacer) rDNA sequence analysis. Selection process to determine which isolate to be administered to the fish was performed by measuring extracelular amylase, protease, and lipase enzyme activity of the yeast. As many as 100 microliters of 7 x 10 to the power of 7 CFU/ml yeast was administered orally to cantang grouper. Viability test was performed by reisolating the yeast from cantang groupers intestines and ITS rDNA sequence amplification using specific primer. Nine yeast isolate was used in this study, 4 of which was isolated from orange-spotted groupers intestines, and another 5 was the laboratorys collection. Extracelular amylase activity were observed on the selected yeasts, i.e., Lodderomyces elongisporus and C. orthopsilosis. The result of yeast administration to cantang grouper showed that L. elongisporus could not survive living on the digestive tract. Whereas C. orthopsilosis could survive living on the digestive tract up to 9 days of observation. C. orthopsilosis has no potential as a probiotic candidate, since there was no significant effect on cantang groupers digestive enzyme observed and this type of yeast probably even pathogenic.

Kata Kunci : identifikasi molekuler, isolasi, kerapu cantang, marine yeast, probiotik