ANALISIS GEN KAPPA KASEIN (k-Kasein) PENYANDI PROTEIN SUSU PADA SAPI PERAH PERIODE LAKTASI YANG BERASAL DARI KLATEN DAN MAGELANG
ZELFIN FADLIAH, Dr. drh. Trini Susmiati, MP; Dr. drh. Claude Mona Airin, MP; Dr. drh. Yanuartono, MP
2015 | Skripsi | S1 KEDOKTERAN HEWANBeberapa variasi genetik ditemukan pada sebagian besar protein susu dan berpengaruh pada produksi susu. Gen kappa kasein (k-kasein) merupakan salah satu gen penyandi protein susu yang dapat mempengaruhi produksi susu sapi perah. Pada sapi perah telah diidentifikasi umumnya k-kasein terdiri dari dua alel yaitu alel A dan B (sapi dengan genotipe AA, AB dan BB). Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji gen penyandi k-kasein dengan menggunakan urutan DNA gen k-kasein dari sapi perah daerah Klaten dan Magelang. Isolasi DNA menggunakan sampel darah dari 6 ekor sapi perah, 3 ekor dari BBPTU Klaten dan 3 ekor dari BBPTU Magelang. Ekstraksi DNA menggunakan Kit No. GB 100/Lot. No. JM02202, hasil isolasi digunakan sebagai media untuk Polymerase Chain Reaction (PCR) dengan primer forward dan reverse: K1 (5'-CAC GTC ACC CAC ACC CAC ATT TAT C-3') dan K2 (5'-TAA TTA GCC CAT TTC GCC TTC TCT GT-3'). Hasil PCR ini dilakukan sekuensing dan dianalisa menggunakan program MEGA 6.06. Hasil penelitian menunjukkan, bahwa gen k-kasein penyandi protein susu setelah dianalisis dengan program MEGA 6.06, diperoleh panjang nukleotida 378 bp. Berdasarkan profil polimorfisme dari hasil sekuensing, diperoleh sifat heterozigot (AB) terdapat pada 2 ekor sapi yang berasal dari Klaten, sedangkan yang berasal dari Magelang dan 1 ekor sapi dari Klaten bersifat homozigot (AA, BB). Jadi dapat disimpulkan bahwa gen yang menyandi protein susu (k-kasein) pada sapi perah dapat digunakan sebagai marker (penanda).
Genetic variation was found in most of milk protein and affected to milk production. Kappa casein (k-casein) gene is one of the milk proteins that affects milk production of dairy cattle. Generally, k-casein was identified consists of two alleles are alleles A and B (cow with genotype AA, AB and BB) in dairy cattle. The objective of this research is to assess that k-casein encodegene using DNA from dairy cattle in Klaten and Magelang. DNA isolation using blood samples from six dairy cattle, three tails from BBPTU Klaten and three tails from BBPTU Magelang. DNA extraction using the Kit No. GB 100/Lot. No. JM02202, the results of DNA isolation used as a template for Polymerase Chain Reaction (PCR) with primers namely forward and reverse : K1 (5'-CAC GTC ACC CAC ACC CAC ATT TAT C-3') and K2 (5'-TAA TTA GCC CAT TTC GCC TTC TCT GT-3'). The results of that PCR was arranged sequantially and analyzed using the MEGA 6.06 program. The results of analysis k-casein gene using MEGA 6.06,obtained the length of nucleotides 378 bp. Based on polymorphism profile sequencing results, obtained properties heterozygous (AB) found in two cows are originating from Klaten, while derived from Magelang and one from Klaten be homozygous (AA, BB). In which that encoded proteins of milk (k-casein) in dairy cattle can be used as a marker.
Kata Kunci : sapi perah, k-kasein, DNA, Homozigot, Heterozigot