KARAKTERISASI MOLEKULAR DAN PROFIL METABOLIT SEKUNDER BAKTERI ENDOFIT AKAR PURWOCENG (Pimpinella pruatjan Molk.) SEBAGAI ANTIBAKTERI TERHADAP Staphylococcus aureus

SARTIKA G.P., Dr. Yekti Asih Purwestri, S.Si., M.Si. ; Prof.Drs. Langkah Sembiring, M.Sc., Ph.D.

2015 | Tesis | S2 Biologi

Studi terbaru tentang antibiotik yang dihasilkan oleh bakteri endofit diperlukan mengingat terjadinya peningkatan bakteri yang resisten obat. Dua puluh delapan isolat bakteri endofit dari purwoceng (Pimpinella pruatjan Molk.) telah diuji kemampuannya untuk menghambat pertumbuhan patogen S. aureus. Pada penelitian ini 4 isolat potensial menunjukkan aktivitas untuk menghambat pertumbuhan S. aureus dengan waktu fermentasi optimum isolat DG1 pada jam ke-46, isolat GP11 dan isolat GP12 pada jam ke-50 dan isolat RP6 pada jam ke-72. Senyawa bioaktif diekstrak dari medium fermentasi menggunakan etil asetat, diikuti dengan kromatografi lapis tipis (KLT) untuk mengetahui keberadaan alkaloidnya. Status taksonomi dari isolat ditentukan dengan analisis BLAST berdasarkan sekuen gen 16S rRNA. Hasil zona hambatan dari 500mg/ml ekstrak kasar DG1, GP11, GP12, dan RP6 terhadap S.aureus masing-masing adalah 0,78; 1,18; 0,95 dan 0,80 cm. Uji KLT menunjukkan bahwa bakteri endofit menghasilkan senyawa alkaloid dan dari analisis BLAST berdasarkan gen 16S rRNA isolat memiliki kemiripan dengan Bacillus subtilis (DG1, GP11 dan GP12) dan Bacillus cereus (RP6).

Recent study on antibiotic produced by endophytic bacteria is crucial to fight against of drug resistant bacteria. Twenty eight isolates of endophytic bacteria from purwoceng (Pimpinella pruatjan Molk.) have been screened for capabality to inhibit the growth of S. aureus. In the present study 4 potential isolates showed activity to inhibit the growth of S. aureus, fermentation time which isolates DG1 optimum at the 46th hour, isolates GP11 and GP12 at the 50th hour and isolates RP6 at 72nd hour. Bioactive compounds were extracted from culture broth using ethyl acetate, followed by Thin layer chromatography (TLC) for metabolic profiling to identify the alkaloid compounds. Taxonomic status of the isolates was determined by BLAST analysis based on 16S rRNA sequences. The result of inhibition test from 500mg/ml crude extract DG1, GP11, GP12 and RP6 against S. aureus respectively are 0,78; 1,18; 0,95 dan 0,80 cm. Thin Layer Chromatography assay showed that endophytic bacteria produce alkaloid compound and from BLAST analysis based on 16S rRNA gene sequences isolates closely related to Bacillus subtilis (DG1, GP11, and GP12) and Bacillus cereus (RP6).

Kata Kunci : Staphylococcus aureus, antibakteri, purwoceng, metabolit sekunder, sekuensing