POLIMORFISME GEN CYTOCHROME P450 FAMILI 2 SUBFAMILI E POLIPEPTIDA 1 (CYP2E1) DAN KEBIASAAN MEROKOK SEBAGAI FAKTOR RISIKO KARSINOMA NASOFARING DI YOGYAKARTA
SAIHAS SUHDA, Jajah Fachiroh, S.P., M.Si., Ph.D; Dewi K. Paramita, S.Si., M.Si, Ph.D
2015 | Tesis | S2 Ilmu Kedokteran Dasar dan BiomedisLatar Belakang. Paparan karsinogen dan faktor genetik berperan dalam perkembangan karsinoma nasofaring (KNF). Cytochrome P450 2E1 (CYP2E1) merupakan enzim yang berperan mengaktivasi nitrosamin khas tembakau. studi sebelumnya melaporkan bahwa polimorfisme CYP2E1 berhubungan dengan risiko KNF di populasi Taiwan, Cina dan Thailand. Tujuan. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui hubungan polimorfisme CYP2E1, kebiasaan merokok dan risiko KNF. Metode. Isolasi DNA dari buffycoat 119 kasus dan 119 kontrol laki-laki suku Jawa. Genotipe rs 3813865, rs 2070672 dan rs 3813867 pada gen CYP2E1 dideteksi menggunakan tetra primer ARMS PCR. Regresi logistik digunakan untuk menghitung nilai Odds Ratio dengan model pewarisan aditif. Hasil. Genotipe homozigot mutan rs 3813865 atau rs 2070672 meningkatkan risiko KNF dengan OR masing-masing 1,80 (95% CI : 0.69 - 4.67) dan 1,77 (95% CI : 0,64 - 4,90). Genotipe heterozigot rs 3813867 bersifat protektif terhadap KNF (OR 0,83; 95% CI : 0,45 - 1,54). Hasil ini mengkonfirmasi penelitian sebelumnya di Malaysia. Kebiasaan merokok tidak mempengaruhi risiko KNF pada populasi dengan polimorfisme CYP2E1. Kesimpulan. Polimorfisme CYP2E1 berhubungan dengan risiko KNF
Background. Carcinogenic exposure and genetic factor play role in development of nasopharyngeal carcinoma (NPC). The cytochrome P450 2E1 (CYP2E1) is a phase I metabolism enzyme that activates nitrosamine presents in cigarrete smoke. CYP2E1 polymorphisms associate with risk of NPC in Taiwan, China and Thailand. Objective. To investigate the association between CYP2E1 polymorphisms, smoking habit and risk of NPC. Methods. The DNA was extracted from buffycoat of 119 cases and 119 controls of Javanese male. Genetic variation of rs 3813865, rs 2070672, rs 3813867 located in CYP2E1 gene was determined using tetra primer ARMS - PCR. Risk analysis was calculated using logistic regesion with additive model inheritance. Results. Homozygote mutant of rs 3813865 or rs 2070672 were increase NPC risk with OR 1,80 (95% CI : 0.69 - 4.67) and OR 1,77 (95% CI : 0,64 - 4,90), while heterozygote of rs 3813867 has protective effect to NPC (OR 0,83; 95% CI : 0,45 - 1,54). Our result confirm the previous study in Malaysian Chinese population. Risk of NPC with CYP2E1 polymorphism did not affect by smoking habit. Conclusion. We suggest that CYP2E1 polymorphisms has associated with NPC risk.
Kata Kunci : tetra primer ARMS-PCR, polimorfisme CYP2E1, deteksi SNP.; CYP2E1 polymorphisms; nasopharyngeal carcinoma; smoking; tetra primer ARMS-PCR.