ANALISIS MOLEKULER PADA PERLEKATAN DAN FERMENTASI INULIN SECARA In Vitro STRAIN Lactobacillus DAN Pediococcus ASAL SISTEM PENCERNAAN BAYI

SRI LESTARI, Widodo, S.P., M.Sc., Ph.D.; Prof. drh. Widya Asmara, S.U., Ph.D.

2015 | Tesis | S2 Bioteknologi

Bakteri Asam Laktat (BAL) merupakan probiotik yang dapat diisolasi dari sistem pencernaan bayi. Salah satu kriteria utama probiotik adalah dapat melakukan perlekatan dan berkolonisasi pada saluran pencernaan inang. Pertumbuhan probiotik dapat ditingkatkan dengan menggunakan prebiotik seperti inulin. Gen perlekatan (map, mub, bac, tuf (EFTu)) dan gen pendegradasi inulin sebagai sumber karbon (inuAP, levH1, inulinase, beta-fructofuranosidase) oleh Lactobacillus casei (strain AP dan AG) dan Pediococcus acidilactici (strain BE dan BK) dipelajari dengan PCR. Profil protein pada semua strain yang ditumbuhkan pada medium musin dan pada medium modifikasi inulin juga diamati dalam penelitian ini. Berdasarkan analisis gen untuk perlekatan pada semua strain memiliki gen mub dan tuf (EFTu), dan untuk fermentasi inulin, semua strain memiliki gen penyandi beta-fructofuranosidase. Hasil SDS-PAGE menunjukkan protein intraselullar yang diduga berperan dalam proses perlekatan memiliki berat 25 dan 75 kDa, dan protein ekstraselullar yang diduga berperan dalam proses perlekatan memiliki berat 24 kDa. Protein intraselullar yang diduga berperan dalam proses fermentasi inulin memiliki berat 50, 75 dan 210 kDa dan protein ekstraselullar yang diduga berperan dalam proses fermentasi inulin memiliki berat 24 kDa. Dapat disimpulkan bahwa tidak semua probiotik memiliki gen map dan bac meskipun kedua gen tersebut berperan dalam perlekatan. Tidak semua probiotik yang tidak mampu melakukan fermentasi inulin tidak memiliki gen penyandi beta-fructofuranosidase, hal ini kemungkinan disebabkan oleh rendahnya tingkat ekspresi gen atau kurangnya sistem penyerapan fruktan yang memadai.

Lactid Acid Bacteria (LAB) is probiotics that can be isolated from digestive system of infants. One of the key selection criteria for potential probiotics is the ability to adhere and colonise the host gastrointestinal tract. Probiotic growth can be enhanced by using prebiotics such as inulin. The mucus adhesion genes (mub, tuf (EFTu), bac, map) and genes of the utilization of inulin as carbon source (inuAP, levH1, inulinase, beta-fructofuranosidase) by Lactobacillus casei (strain AP and AG) and Pediococcus acidilactici (strain BE and BK) was studied by PCR. Protein profiles on all strains were grown on medium of mucin and medium of inulin was also observed in this study. Based on gene analysis for adherence all strains had mub gene and tuf (EFTu) gene, and for inulin fermentation, all strain had gene coding of beta-fructofuranosidase. The result of SDS-PAGE showed intracellular proteins are thought to play a role in the process of adhesion has molecular weight 25 and 75 kDa, and ekstracellular proteins are thought to play a role in the process of adhesion has molecular weight 24 kDa. Intracellular proteins are thought to play a role in the process of inulin fermentation has a weight of 50, 75 and 210 kDa and ekstracellular proteins are thought to play a role in the process of inulin fermentation has a weight of 24 kDa. It can be concluded that not all probiotics have the gene map and bac although both of these genes play a role in adhesion. Not all probiotics are not able to ferment inulin not have beta-fructofuranosidase genes, it is likely caused by low levels of gene expression or lack of adequate absorption fructan system.

Kata Kunci : Keywords : Probiotics, Lactobacillus casei, Pediococcus acidilactici, Adhesion and Inulin