FENOTIPIK, GENOTIPIK DAN HISTOPATOLOGI Nocardia seriolae, Nocardia Nova dan Nocardia asteroides PADA IKAN GURAMI ( Osphronemus gouramy) DI JAWA TENGAH

DWI LANTIANI, Prof. drh. Kurniasih, MV.Sc., Ph.D; Dr. drh. Surya Amanu, M.S.

2015 | Tesis | S2 Sain Veteriner

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan Nocardiosismelalui identifikasi secara morfologi dan molekuler penyebab Nocardiosis dan untuk mengetahui perubahan histopatologis organ akibat infeksi alami Nocardia sp. pada ikan gurami (Osphronemus gouramy) di perairan DIY dan Jawa Tengah.Penelitian dilakukan di Laboratorium Pengujian Stasiun Karantina Ikan, Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan Kelas 1 Yogyakarta, Laboratorium Mikrobiologi dan Laboratorium Patologi Fakultas Kedokteran Hewan UGM. Penelitian meliputi 3 tahap kegiatan yaitu (1) Isolasi dan Identifikasi bakteri dengan uji presumtif dan biokimia, (2) PemeriksaanHistopatologi pada organ yang bergranuloma,(3) Pemeriksaan Molekuler yang dilakukan dengan uji PCR menggunakan primer universal 16 rDNA daerah 27F (5,-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3') dan 1492R (5'-TACGGYTACCTTGTTACCACTT-3') kemudian dilanjutkan dengan sekuensing. Hasil identifikasi secara morfologi dan biokimia menunjukkan 3 isolat bakteri yang berasal dari daerah Jawa Tengah (Kabupaten Cilacap dan Klaten) dan DIY (Kabupaten Bantul) menunjukkan bakteri mengarah ke genus Nocardia sp.. Hasil identifikasi secara molekuler menunjukkan isolat Cilacap memiliki homologi sekuen dengan Nocardia seriolae Genbankdan isolat Klaten memiliki homologi sekuen dengan Nocardia novadan Nocardia asteroidsGenbank. Isolat Bantul memiliki homologi sekuen dengan Moraxella osloensis S44-4 GenBank. Hal ini membuktikan bahwa pemeriksaan secara molekuler dapat mendukung pemeriksaan secara morfologi dan biokimia. Infeksi Nocardiosis menyebabkan perubahan histopatologi berupa radang granulomatosa pada organ internal.

PHENOTYPIC, GENOTYPIC AND HISTOPATHOLOGY Nocardia seriolae, Nocardia Nova and Nocardia asteroides ON GOURAMI FISH (Osphronemus gouramy) IN CENTRAL JAVA The aims of this experiment were to determine the existence of Nocardiosis through the identification of morphological and molecular causes of Nocardiosis and to determine the histopathologic changes of organs due to natural infection Nocardia sp. the gourami (Osphronemus gouramy) in the waters of Yogyakarta and Central Java. This experiment was conducted at the Laboratory of Fish Quarantine and Inspection Station Class 1 Yogyakarta, Laboratory of Microbiology and the Laboratory of Pathology, Faculty of Veterinary Medicine. The research included three stages of activities, (1) Isolation and identification of bacteria with presumptive and biochemical tests, (2) Histopathological examination on the granulomatous organ, (3) Molecular examination performed by PCR test using a universal primer 16S rDNA region 27F (5'- AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3') and 1492R (5'-TACGGYTACCTTGTTACGACTT-3'), and followed by sequencing. The results of morphological and biochemical identification showed 3 isolates originating from Central Java (Cilacap and Klaten) and Yogyakarta (Bantul) showed bacteria leads to the genus Nocardia sp.. The identification of molecular shows Cilacap isolate homologous sequences with Nocardia seriolae Genbank and Klaten isolate homologous sequences with Nocardia nova and Nocardia asteroides Genbank. Bantul isolates has a sequence homology with Moraxella osloensis S44-4 Genbank. This proves that the molecular examination can support the morphological and biochemical examination. Nocardiosis infection causes histopathological changes in the form of granulomatous inflammation of the internal organs.

Kata Kunci : Nocardia sp., gurami, fenotip, genotip, PCR