Laporkan Masalah

Deteksi Cyca-DAB1*05 sebagai Marker Antiviral Infeksi Cyprinid herpesvirus-3 pada Ikan Mas Merah Cangkringan (Cyprinus carpio Linn. 1758) Jantan

ZAHRAH NURFADHILAH, Dr.biol.hom Nastiti Wijayanti, S.Si., M.Si.

2015 | Skripsi | BIOLOGI

Cyca-DAB1*05 adalah alel gen Major Histocompatibility Complex (MHC) class II B yang dilaporkan berperan dalam ketahanan terhadap infeksi Cyprinid herpesvirus-3 (CyHV-3) pada ikan mas. Infeksi CyHV-3 menyebabkan penyakit Koi Herpesvirus (KHV) dengan resiko kematian mencapai 80-100% pada jenis ikan mas dan ikan mas koi. Deteksi alel spesifik Cyca-DAB1*05 pada Ikan Mas Merah Cangkringan jantan bertujuan untuk seleksi indukan unggul secara genetik yang tahan terhadap infeksi CyHV-3. Selain itu dilakukan deteksi alel Cyca-DAB1*05 dan CyHV-3 pada anakan Ikan yang mendapatkan perlakuan uji tantang untuk mengetahui pengaruh alel tersebut pada ketahanan terhadap infeksi CyHV-3. Deteksi dilakukan dengan menggunakan PCR dengan primer spesifik baik untuk alel Cyca-DAB1*05 maupun untuk CyHV-3. Indukan jantan yang positif memiliki Cyca-DAB1*05 dipijahkan dengan indukan betina yang tidak memiliki Cyca-DAB1*05. Anakan yang telah berusia ±3 bulan kemudian diuji tantang terhadap CyHV-3 dengan metode kohabitasi. Hasil penelitian menunjukkan terdapat satu ekor indukan jantan yang positif memiliki alel Cyca-DAB1*05 dari 102 induk jantan. Kematian pada anakan ikan uji selama kohabitasi CyHV-3 mencapai 95% dengan kematian tertinggi terjadi pada hari ke 3 setelah kohabitasi. Terdapat dua ekor anakan yang bertahan hidup selama uji tantang terhadap CyHV-3. Semua sampel DNA anakan ikan positif memiliki alel Cyca-DAB1*05 dan hasil deteksi CyHV-3 menunjukkan semua sampel terinfeksi CyHV-3. Dua ekor anakan ikan uji yang masih hidup diduga memiliki ketahanan terhadap CyHV-3 dan membutuhkan penelitian lebih lanjut. Pada penelitian ini, keberadaan alel Cyca-DAB1*05 tidak berperan sebagai marker antiviral infeksi CyHV-3 pada Ikan Mas Merah Cangkringan.

Cyca-DAB1*05 allele is member of Major Histocompatibility Complex (MHC) class II B genes that play a role in the resistance to Cyprinid herpesvirus-3 (CyHV-3) infection in common carp. CyHV-3 infection caused a Koi Herpesvirus (KHV) disease with a high mortality between 80-100% in common carp and koi. Detection Cyca-DAB1*05 specific allele in males Red Cangkringan Common Carp was to select broodstock fish that resistance to CyHV-3 infection based on genetic selection. Detection Cyca-DAB1*05 and CyHV-3 in offspring of common carp was to determine the association between Cyca-DAB1*05 allele on the resistance to CyHV-3 infection. PCR amplification was performed using specific primer for the Cyca-DAB1*05 and CyHV-3 detection. Positif male broodstock which has Cyca-DAB1*05 was breed with the female which does not have Cyca-DAB1*05. The offspring of common carp was challenge to CyHV-3 infection with cohabitation method. The result show that there was only one of 102 male broodstock which has positif of Cyca-DAB1*05 allele. The mortality of common carp offspring during cohabitation reached 95% with the highest mortality rate occur on day 3 after cohabitation. There are two fish that survived from a CyHV-3 infection after the cohabitation challenge. The PCR result show that all of DNA sampels of offspring positive Cyca-DAB1*05 and CyHV-3. Two fish that survived from cohabitation challenge supposedly have ability to resist infection with CyHV-3 need further research. In this study, Cyca-DAB1*05 does not not play a role as antiviral marker to CyHV-3 infection.

Kata Kunci : MHC class II B, Cyca-DAB1*05, CyHV-3, ketahanan penyakit, Cyprinus carpio.

  1. S1-2015-316235-abstract.pdf  
  2. S1-2015-316235-bibliography.pdf  
  3. S1-2015-316235-tableofcontent.pdf  
  4. S1-2015-316235-title.pdf