DETEKSI GEN CAPSID PADA LIMPA SAPI YANG DIINFEKSI DAN TERINFEKSI VIRUS JEMBRANA DENGAN METODE RT-PCR

TAMARA LINAWATI, Dr. drh. Asmarani Kusumawati, M.P.

2015 | Skripsi | S1 KEDOKTERAN HEWAN

Jembrana Disease Virus (JDV) merupakan penyakit viral yang menular pada sapi Bali (Bos Javanicus) yang disebabkan oleh Lentivirus ssRNA dari famili Retroviridae. Jembrana menginfeksi organ limfoid terutama limpa. Diperlukan deteksi dini JDV untuk mencegah penyebarannya. Metode identifikasi dilakukan dengan reverse transcriptase - polymerase chain reaction (RT-PCR). Metode ini memiliki sensitifitas dan keakuratan yang lebih tinggi dibandingkan dengan metode konvensional. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi RNA virus Jembrana dengan metode RT-PCR menggunakan gen capsid. Sampel yang digunakan adalah limpa sapi Bali. Sampel dibuat suspensi, diekstrasi untuk mendapatkan RNA dengan kit ekstrasi RNA dari High Pure Viral RNA Kit. Kemudian dilakukan proses RT-PCR menggunakan uji one step RT-PCR dengan desain primer F3 dan B3 yang akan mengamplifikasi gen capsid pada virus JDV dan menghasilkan produk amplifikasi dengan panjang band DNA 230 bp. Produk amplifikasi diamati dengan gel agarose elektroforesis konsentrasi 2 persen. Hasil penelitian isolat RNA sampel organ limpa menunjukkan positif terinfeksi JDV.

Jembrana Disease Virus is a contaigous viral disease of Balinese cow (Bos Javanicus) that caused by Lentivirus's ssRNA from Retroviridae famili. Jembrana infects lymphoid organ, especially the spleen. Jembrana Disease Virus required an early detection to prevent the spread. Identification methods are done using reverse transcriptase - polymerase chain reaction (RT-PCR). This method has higher sensitivity and accuracy than the conventional method. This research aims to detect Jembrana virus's RNA with RT-PCR method using capsid gene. Sample used in this research are Balinese cow spleen. sample are made into suspension, then extracted to get the RNA using RNA extraction kit from High Pure Viral RNA Kit.Then the process continued with RT-PCR using one-step RT-PCR test with primary design F3 and B3 that will amplify the capsid gene of JDV virus and produce product amplification with DNA band lenght 230 bp. Amplified product are observed with agarose electroforesis gel with concentration level of 2 percen. The research result of RNA isolates of spleen organ sample shows positive infection of JDV.

Kata Kunci : Limpa, Jembrana Disease Virus, RT-PCR, Gen gag-ca,Spleen, Jembrana Disease Virus, RT-PCR, GAG-CA gene