ANALISIS KANDUNGAN DAGING TIKUS DALAM BAKSO MENGGUNAKAN METODE POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR) PRIMER SPESIFIK GEN ND1 DNA MITOKONDRIA

FADILLAH PUTRI PATRIA, Dr. Tri Joko Raharjo, M.Si.; Dr. Respati Tri Swasono, S.Si, M.Phil

2014 | Skripsi | S1 KIMIA

Telah dilakukan penelitian mengenai analisis kandungan daging tikus dalam bakso menggunakan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) primer spesifik gen ND1 DNA mitokondria. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan metode deteksi cemaran daging tikus pada bakso berbasis uji DNA. Penelitian ini meliputi dua tahap yaitu unjuk kerja metode PCR berupa uji spesifikasi, penentuan batas deteksi dan aplikasi metode untuk uji bakso yang dijual di pasar. Ekstraksi DNA dilakukan dengan metode fenol-KIAA kemudian dianalisis dengan elektroforesis dan spektrofotometri UV. Isolat DNA digunakan sebagai cetakan dalam proses amplifikasi dengan menggunakan primer spesifik dari gen ND1, yaitu primer forward (5- CGG CAT CCT ACA ACC ATT TGC-3) dan primer reverse (5-CGG CTC GTA AAG CTC CGA A-3). Tahap-tahap tersebut dilakukan baik dalam uji spesifitas, penentuan batas deteksi maupun aplikasi metode. Hasil amplifikasi PCR terhadap isolat DNA dari bakso menghasilkan fragmen dengan panjang 278 pb. Unjuk kerja metode yang dilakukan menunjukan bahwa metode ini spesifik digunakan untuk mendeteksi cemaran daging tikus dalam bakso tikus dengan batas deteksi hingga konsentrasi 5% (b/b). Enam sampel bakso yang dijual di warung, supermarket, dan pasar tradisional tidak menunjukkan adanya kontaminasi daging tikus.

Analysis of rat meat content in meatball by using Polymerase Chain Reaction (PCR) specific primer ND1 gene mitochondrial DNA has been performed. The aim of the study was to develop a detection method for rat contamination in meatballs based on DNA test. The study consisted of two stages, i.e. performance tests (specificity test and sensitivity test) and application of the method for testing meatballs sold in market. DNA was extracted using phenol-CIAA then analyzed by electrophoresis and UV spectrophotometry. DNA isolates were used as the templates in the amplification process by using specific primers of genes ND1, namely forward primer (5'- CGG CAT CCT ATT ACA ACC TGC-3 ') and reverse primer (5'-CGG CTC CTC GTA AAG CGA A-3'). The same protocols were performed in the specifity test, sensitivity test and application of the methods. The result of PCR amplification of isolated DNA from meatballs was fragment with length of 278 bp. The performance tests showed that the method could be used to detect rat meat contamination in meatballs with limit of detection to the level of 5% (w/w). Contamination of rat meat were not found in six samples of meatballs sold in stall, supermarkets, and traditional markets.

Kata Kunci : Polymerase Chain Reaction, Daging Tikus, Bakso, Analisis Halal