SELEKSI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI RIZOSFER ALLIUM SPP. YANG BERSIFAT ANTAGONIS TERHADAP FUSARIUM OXYSPORUM F. SP. CUBENSE

ANA WIJI RAHAYU, Prof. Dr. Ir. Siti Subandiyah, M.Agr.Sc.

2014 | Skripsi | ILMU HAMA & PENYAKIT TUMBUHAN

Penyakit layu fusarium yang disebabkan oleh Fusarium oxysporum f.sp.cubense (Foc) merupakan salah satu penyakit penting yang menyerang tanaman pisang. Pengendalian penyakit ini bisa melalui teknik budidaya seperti tumpangsari dan pemanfaatan rizobakteria antagonis terhadap Foc. Tujuan penelitian ini adalah untuk memperoleh bakteri dari rizosfer Allium spp. yang berpotensi menekan perkembangan Foc secara in vitro dan mengidentifikasi rizobakteria yang berpotensi sebagai agens antagonis terhadap Foc secara molekuler dengan sekunseing gen ribosomal 16S. Perlakuan yang digunakan dalam penelitian ini yaitu tanaman pisang ditumpangsarikan dengan 4 jenis Allium spp. (kucai, wakegi, loncang, bawang merah) dibandingkan dengan kontrol. Metode penelitian meliputi isolasi bakteri dari tanah dan pengujian antagonisme secara in vitro dengan metode oposisi langsung. Selanjutnya, rizobakteria antagonis yang mampu menghambat Foc diidentifikasi secara morfologi dan molekuler dengan sekuensing gen 16S rRNA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat 14 isolat rizobakteria antagonis yang ditemukan pada rizosfer Allium spp.dan kontrol. Lima isolat bakteri memiliki potensi sebagai antagonis kuat yaitu isolat KUC -1, KUC -4, KUC -6, LON -6 dan BWM -15. Hasil sekuen gen 16S rRNA, isolat KUC -1, KUC -4, KUC -6, LON -6 memiliki hubungan kekerabatan terdekat dengan Bacillus subtilis, sedangkan isolat BWM -15 memiliki hubungan kekerabatan terdekat dengan Bacillus methylotrophicus. Kata kunci : Rizobakteria, Allium spp., Fusarium oxysporum f.sp.cubense

Fusarium wilt disease caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc) is an important soilborne disease of banana. Disease control can be done by culture techniques such as by intercropping and antagonistic rhizobacteria application. The aim of this research was to obtain antagonistic rhizobacteria against Foc from Allium spp. rhizosphere through in vitro assay and to identify the antagonistic rizobacteria with 16S rRNA sequencing. The treatments given were intercropping banana with 4 kind of Allium spp. : chinese leek, buching onion, shallot, and wakegi compared to control treatment. The antagonistic rizobacteria with good performance of antagonism through direct opposition method were identified morphologically and sequenced on 16S rRNA fragment. The result showed that 14 isolates antagonis rizobacteria originated from samples. The five strongest antagonistic rizobacteria isolates were KUC -1,KUC -4, KUC -6, LON-6, and BWM -15. The result of 16S rRNA sequencing showed that KUC -1,KUC -4, KUC -6, LON-6 was closely related to Bacillus subtilis, and BWM -15 was closey reated to Bacillus methylotrophicus. Keyword : Rhizobacteria, Allium spp., Fusarium oxysporum f.sp.cubense

Kata Kunci : Rizobakteria, Allium spp., Fusarium oxysporum f.sp.cubense