IDENTIFIKASI CEMARAN DAGING TIKUS DALAM BAKSO SAPI MENGGUNAKAN PRIMER SPESIFIK GEN CYTOCHROME b DNA MITOKONDRIATIKUS DENGAN METODE REAL-TIME PCR (POLYMERASE CHAIN REACTION)

DIAN CITRA NINGTYAS, Prof. Dr. Sudjadi, M.S., Apt.

2014 | Skripsi | FARMASI

Pengawasan produk makanan di Indonesia belum berjalan dengan baik. Kasus pelanggaran terhadap produksi makanan masih banyak terjadi, contohnya adalah pemalsuan bakso sapi menggunakan daging tikus. Penjaminan keaslian bakso mutlak diperlukan untuk menjamin bahwa bakso yang dijual sesuai dengan yang terlabel. Metode deteksi daging tikus dalam bakso yang diklaim sebagai bakso sapi perlu dikembangkan sebagai bentuk pengawasan pada produk bakso yang beredar. Salah satu metode yang dapat diaplikasikan adalah RealtimePolymerase Chain Reaction (RT-PCR). RT-PCR diaplikasikan dengan memakai primer CytbRglu2L dan primer CytbRCb9H yang spesifik mengamplifikasi gen Cythochrome b pada DNA mitokondria tikus namun tidak mengamplifikasi DNA sapi. Melting Curve Analysis(MCA) digunakan untukmelihatspesifitas amplikon.Amplikon yang spesifik ditandai dengan munculnya satu puncak suhu lebur pada kurva MCA dan tidak ada kenaikan fluoresensi pada kurva amplifikasi. Untuk memperkuat data analisis perlu juga ditentukan sensitifitas, batas deteksi, serta efisiensi metode ini. Metode RT-PCR yang dilengkapi primer CytbRglu2L dan Primer CytbRCb9H dapat secara spesifik mengamplifikasi DNA tikus dalam campuran biner bakso sapi dengan sensitifitas hingga 5% kadar daging tikus. Didapatkan efisiensi amplifikasi sebesar 122,90% dengan batas deteksi DNA tikus sebesar 11,2 pg.

Supervision of food products in Indonesia is not going well. Cases of violation of the production of food is still a lot going on, for example, is a forgery beef meatballs using rat meat. Guarantee authenticity meatballs are absolutely necessary to ensure that the meatballs are sold in accordance with the label. Methods for detection of rat meat in the meatball that is claimed as beef meatballs need to be developed as a form of control on the outstanding meatball products. One method that can be applied is the Real-time Polymerase Chain Reaction (RTPCR). RT-PCR was applied using specific primer (CytbRglu2L and CytbRCb9H primer) amplifying Cythochrome b gene in the mitochondrial DNA of mice but not amplify cow DNA. Melting Curve Analysis (MCA) is used to view the amplicon specificity. Specific amplicons are marked by the emergence of a peak melting temperature of the MCA curve and there is no increase in the fluorescence amplification curve. To strengthen the data analysis, the sensitivity, detection limit, and the efficiency of this method are also determined. RT-PCR method incorporating CytbRCb9H and CytbRglu2L primer can specifically amplify DNA of mice in a binary mixture of beef meatballs with a sensitivity of up to 5% levels of rat meat. Amplification efficiency is obtained ini 122.90% with a detection limit of 11.2 pg mouse DNA.

Kata Kunci : bakso, Real-timePCR, primer,Melting Curve Analysis