KARAKTERISASI ISOLAT BAKTERI SELULOLITIK DENGAN AMPLIFIED RIBOSOMAL DNA RESTRICTION ANALYSIS (ARDRA)

PRATOMO HERSUPRAYOGI, Dr. Yekti Asih Purwestri, S.Si., M.Si.

2014 | Skripsi | BIOLOGI

Bakteri selulolitik merupakan organisme yang mampu menghasilkan selulase. Bakteri selulolitik yang diisolasi dari lambung ikan bandeng (Chanos chanos) belum dilakukan karakterisasi secara molekular. Karakterisasi molekular dilakukan dengan melihat pola fragmen produk digesti sekuen 16S rDNA oleh beberapa enzim restriksi. Tujuan dari penelitian ini adalah mempelajari pola fragmen produk digesti sekuen 16S rDNA bakteri selulolitik oleh beberapa enzim restriksi. Penelitian ini terdiri dari beberapa tahap, yaitu (1) pengamatan morfologi koloni dan sel (2) isolasi DNA genom (3) amplifikasi sekuen 16S rDNA dengan PCR (4) pemotongan produk PCR dengan enzim endonuklease restriksi HaeIII, HinfI, dan RsaI. Fragmen produk digesti sekuen 16S rDNA memperlihatkan pola yang sama untuk semua isolat, kecuali isolat BSA B1.

Selulolitic bacterias are organism that have capability of celulose production. Selulolitic bacterias isolated from Bandeng gastric have not been yet characterized by means of molecular approach. Molecular characterization was observed using the pattern of 16S rDNA sequence digestion product by some restriction enzymes. The objective of this research was to discover the pattern of 16S rDNA sequence digestion product some restriction enzymes. This research conducted with several steps including (1) cell and colony morphology observation (2) DNA genome isolation (3) amplification of 16S rDNA sequence using PCR (4) digestion of PCR products by restriction endonuclease enzyme HaeIII, HinfI, and RsaI. The patterns of 16S rDNA sequence digestion product were similar for all of isolates, except BSA B1 isolate.

Kata Kunci : Bakteri selulolitik, 16S rDNA, ARDRA.