PERAKITAN DAN PEMETAAN GEN KETAHANAN TERHADAP POWDERY MILDEW DENGAN PENANDA SEQUENCE CHARACTERIZED AMPLIFIED REGION PADA MELON (Cucumis melo L.) KULTIVAR TACAPA

Ahdiat Agriansyah, Dr. Budi Setiadi Daryono, M.Agr.Sc.

2013 | Tesis | S2 Biologi

Budidaya tanaman melon (Cucumis melo L.) telah banyak dikembangkan di Indonesia. Varietas melon yang telah dibudidayakan mempunyai keunggulan yang berbedabeda, tetapi umumnya masih rentan terhadap penyakit. Powdery mildew adalah salah satu penyakit yang menginfeksi tanaman melon hampir diseluruh sentra budidaya melon di Indonesia. Penyakit ini disebabkan oleh jamur Podosphaera xanthii. Metode pemuliaan tanaman terus dikembangkan untuk menghasilkan bibit melon unggul dan tahan terhadap powdery mildew. Tahun 2009 telah dihasilkan melon TACAPA yang tahan terhadap powdery mildew dan memiliki kualitas buah yang baik, tetapi sifat ketahanan tersebut masih mengalami segregasi pada generasi kedua (F2). Perakitan dan pemetaan gen ketahanan terhadap powdery mildew dengan penanda SCAR pada melon kultivar TACAPA dilakukan untuk didapatkan bibit melon kultivar TACAPA yang unggul. Penelitian ini dilakukan penanaman dan persilangan melon TACAPA dengan PI 371795 dan Action 343, sehingga dihasilkan dua generasi baru yaitu melon TACAPA x PI 371795 dan melon TACAPA x Action 434. Tanaman melon hasil persilangan ditanaman di greenhouse sebanyak 110 tanaman. Kemudian diambil daunnya untuk diekstraksi dan amplifikasi DNA dengan penanda SCAR. Hasil amplifikasi DNA dianalisis menggunakan tes Chi-square. Hasil tes Chi-square digunakan untuk analalisis linkage map dengan map marker. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pola pewarisan gen ketahanan terhadap powdery mildew pada melon hasil perakitan dikendalikan oleh gen dominan tunggal (Pm-I). Posisi penanda molekular SCAR yang terpaut dengan gen (Pm-I) penyandi ketahanan tanaman melon TACAPA x PI 371795 terhadap powdery mildew adalah 31,5 cM sedangkan pada tanaman melon TACAPA x Action 434 adalah 3,7 cM.

Cultivation of melon ( Cucumis melo L. ) has been developed in Indonesia. Cultivated melon varieties have different advantages, but generally still vulnerable to disease. Powdery mildew is a disease that infects nearly all melon plants at the melon cultivation centers in Indonesia. The disease is largely attributable to the fungus Podosphaera xanthii. Plant breeding methods continue to be developed for producing superior melon seeds and resistant to powdery mildew. In 2009, a new melon cultivar, called TACAPA has been produced and it is resistant against powdery mildew. The cultivar has good fruit quality, however still show segregation in second generation (F2). Assembly and mapping of resistance gene against powdery mildew with SCAR marker on melon cultivars TACAPA are needed to produce superior melon seeds of TACAPA. This study conducted crossing of TACAPA with PI 371795 and Action 343, so that the resulting two new generations are PI 371 795 x TACAPA and TACAPA x Action 434. Melons from crosses were planted in a greenhouse as much as 110 plants. Then the sample of the leaves were used for DNA extraction and amplification with SCAR marker. DNA amplification products were analyzed by Chi-square (X2) test. Chi-square test results were used to analysis linkage map with map markers. The results showed that the pattern of inheritance of resistance genes against powdery mildew on melons TACAPA controlled by a single dominant gene ( Pm-I). The position of SCAR molecular marker linked to gene Pm-I resistance against powdery mildew on TACAPA x PI 371795 was 31,5 cM, while on TACAPA x Action 434 was 3, 7 cM.

Kata Kunci : Perakitan, C. melo L., TACAPA, powdery mildew, SCAR, Linkage map, Pm-I