ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PELARUT FOSFAT DARI TANAH RHIZOSFER TANAMAN TEH

PUPUT PUTRI N, Dr. Ir. Jaka Widada, M.P.

2013 | Skripsi | MIKROBIOLOGI PERTANIAN

Bakteri pelarut fosfat (PSB) adalah sekelompok bakteri yang memiliki kemampuan untuk melarutkan senyawa fosfat anorganik sukar larut, seperti trikalsium fosfat, dikalsium fosfat, hidroksiapatit, dan batuan fosfat. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk isolasi, seleksi, dan identifikasi PSB dari tanah rizosfer tanaman teh. PSB diisolasi dari rizosfer tanaman teh pada 4 klon yaitu PGL11, PGL4, TRI 2025 dan Gambung 3 diambil dari PT. Pagilaran, Batang, Jawa Tengah. Isolat-isolat yang diperoleh diuji kemampuannya dalam melarutkan trikalsium fosfat dalam medium cair. BOXAIR-PCR digunakan untuk menentukan PSB untuk dikarakterisasi lebih lanjut. Sekuensing gen 16S rRNA digunakan untuk mengidentifikasi PSB terpilih. Dua puluh PSB yang membentuk zona jernih di sekitar koloni pada media Pikovskaya agar diperoleh pada penelitian ini. Berdasarkan pembentukan zona bening dan asal isolat, 13 isolat dipilih untuk diuji kemampuanya melarutkan fosfat secara kuantitatif. Inokulasi 13 isolat terpilih pada media cair Pikovskaya menurunkan pH medium dan kemampuan untuk melarutkan fosfat adalah antara 107,2-203,7 µg/ml setelah diinkubasi selama 48 jam. Analisis BOXAIR-PCR mengungkapkan enam PCR profil yang berbeda pada tingkat kemiripan 70%, yang mencerminkan keragaman genotipe yang tinggi antara PSB yang diperoleh. Berdasarkan 16S rRNA gen sequencing hasil dari enam isolat yang berbeda secara genotipe, menunjukkan bahwa lima isolat memiliki kesamaan yang tinggi dengan Burkholderia dan satu isolat memiliki kemiripan yang tinggi dengan Serratia

Phosphate solubilizing bacteria (PSB) is a group of bacteria that have the ability to dissolve insoluble inorganic phosphate compounds, such as tricalcium phosphate, dicalcium phosphate, hydroxyapatite, and rock phosphate. The purpose of this study was to isolation, selection, and identification of PSB from the rhizosphere soil of tea plants. PSB isolated from the rhizosphere of tea plants in the clone 4 PGL11, PGL4, TRI 2025 and Gambung 3 taken from PT . Pagilaran, Batang, Central Java. Obtained isolates were tested for their ability to dissolve tricalcium phosphate in a liquid medium. BOXAIR - PCR was used to determine the PSB for further characterized. Sequencing of 16S rRNA gene was used to identify the selected PSB. Twenty PSB which formed clear zones around colonies on Pikovskaya agar medium were obtained in this study. Based on clear zone formation and origin of isolates, 13 isolates were selected to test his ability to dissolve phosphate quantitatively. Inoculation of 13 selected isolates in Pikovskaya liquid media lowered pH of the medium and the ability to dissolve phosphate was between 107.2 to 203.7 µg/ml after incubation for 48 hours. BOXAIR analysis - PCR revealed six different PCR profiles on the degree of similarity of 70%, which reflects the high diversity of genotypes between PSB obtained. Based on 16S rRNA gene sequencing results from six different isolates of genotype, showed that the five isolates had high similarity with Burkholderia and one isolate had a high similarity with the Serratia.

Kata Kunci : Bakteri pelarut fosfat, rhizofer tanaman teh, analisis gen 16S rRNA.