KAJIAN MOLEKULER AYAM KEDU, BURAS DAN CEMANI MENGGUNAKAN POLYMERASE CHAIN REACTION - RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DEOXYRIBONUCLEIC ACID (PCR-RAPD)

WINDA AYUNINGTYAS, Dr. drh. Trini Susmiati, M.P.

2013 | Skripsi | KEDOKTERAN HEWAN

Ayam kedu, buras, dan cemani merupakan plasma nutfah Indonesia yang perlu dijaga kelestariannya. Informasi tentang keragaman genetik ayam tersebut masih terbatas dan masih perlu diadakan penelitian. Salah satu usaha untuk mengkaji keragaman informasi genetik ayam tersebut, dapat dilakukan penelitian dengan metode Polymerase Chain Reaction-Random Amplified Polymorphic Deoxyribonucleic Acid (PCR-RAPD) menggunakan primer 3 (5’ GTA GAC CCG T 3’) dan 5 (5' AAC GCG CAA C 3'). Adapun tujuan penelitian ini adalah untuk mengkaji potensi keragaman genetik ayam kedu, buras, dan cemani yang dilihat dari fragmen DNA spesifik dengan metode Polymerase Chain Reaction-Random Amplied Polymorphism Deoxyribonucleic Acid (PCR-RAPD), serta untuk mengkaji apakah ada hubungan kekerabatan antara ayam kedu dan cemani yang diperoleh dari Temanggung; dan ayam buras yang diperoleh dari Purworejo, Jawa Tengah. Hasil penelitian menunjukkan adanya keragaman genetik dalam populasi dan antar populasi, namun tidak dapat digunakan sebagai penanda genetik. Jarak genetik terdekat dalam penelitian ini adalah kedu merah terhadap kedu putih. Jarak genetik paling jauh adalah antara ayam buras terhadap ayam cemani dan ayam cemani terhadap ayam kedu merah.

Kedu chicken, domestic poultry, and cemani is necessary germplasm preserved Indonesia. Information about the genetic diversity of the chicken is still limited and research is still needed to be. One attempt to assess the diversity of the chicken genetic information, the research can be done by the method of Polymerase Chain Reaction-Random Amplified Polymorphic Deoxyribonucleic Acid (PCR-RAPD) using primers 3 (5’ GTA GAC CCG T 3’) and 5 (5' AAC GCG CAA C 3'). The purpose of this study was to examine the potential genetic diversity of kedu chicken, domestic poultry, and cemani as seen from the specific DNA fragments by the method of Polymerase Chain Reaction-Random Amplified Polymorphic Deoxyribonucleic Acid (PCR-RAPD), and to assess whether there is kinship between the kedu chicken and cemani obtained from Temanggung, and domestic poultry obtained from Purworejo, Central Java. The results showed the existence of genetic diversity within populations and among populations, but can not be used as genetic markers. The closest genetic distance in this study are red kedu to white kedu. Farthest genetic distance is between domestic poultry to cemani and cemani to red kedu.

Kata Kunci : ayam kedu, ayam buras, ayam cemani, DNA, PCR-RAPD