KARAKTERISASI MORFOLOGI DAN PENANDA RAPD PULUH AKSESI WORTEL (Daucus carota L. )

WHISNU FEBRY A, Dr.Rudi Hari Murti, S.P., M.P.

2013 | Skripsi | PEMULIAAN TANAMAN

Pengkajian mengenai wortel di Indonesia masih jarang dilakukan. Hal tersebut menyebabkan karakterisasi berdasarkan morfologi dan penanda RAPD pada dua puluh aksesi wortel (Daucus carota L.) sebagai penelitian awal untuk program pemuliaan penting dilakukan. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi variasi aksesi wortel berdasarkan karakteristik morfologi dan penanda genetik. Penelitian dilakukan dengan menggunakan dua puluh aksesi wortel yang dibudidayakan di rumah kaca. Jumlah tanaman di setiap aksesi bervariasi antara 5-16 yang dibagi dalam dua ulangan. Karakter morfologi tanaman individual meliputi dari batang, daun, umbi, dan bunga. Penanda genetik digunakan analisis RAPD dengan menggunakan 5 primer terpilih dari 20 primer yang di screening (OPA 4, OPB 07, OPB 17, OPB 18, OPB dan 20). Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari dua puluh aksesi menunjukkan keanekaragaman morfologi dan genetika. Aksesi 1, 4, 5, 7, 10, 12, 14, 18 dan 23 memiliki kemampuan untuk berbunga tanpa vernalisasi. Keragaman morfologi ditunjukkan oleh koefisien keragaman dalam kisaran 17,5% -77,58% dan pada keragaman genetik adalah 16,92% sampai 46,15% persentase lokus polimorfik. Hasil analisis cluster berdasarkan delapan karakter morfologi menunjukkan bahwa aksesi terbagi dalam dua kelompok pada jarak terdapat 2 kelompok yaitu kelompok pertama aksesi A, 3, 7, 2, 4, 20 , 6, 22, 12, 19, 11 dan kelompok kedua aksesi B, 5, 25, 23, 10, 21, 18. Berdasarkan penanda molekuler, aksesi tersebut terbagi dalam empat kelompok pada jarak 70, yaitu kelompok I aksesi 20, 21, 22, 23, 25; kelompok II terdiri dari aksesi 11, 12, 14, 18, 19; kelompok III terdiri dari aksesi 4, 5, 6, 10 ; kelompok IV terdiri dari aksesi A, B, 1, 2, 4. Hasil pengelompokan berdasarkan morfologi berbeda dari hasil pengelompokan molekuler.

Studies of carrots in Indonesia are rare. Characterization of morphological charactheristic and RAPD of carrot (Daucus carota L.) was important step for plant breeding. The experiment was carried out to identify variation of carrot accessions based on morphological characteristics and genetic markers. Twenty accession of carrots were cultivated in the greenhouse. The number of plants in each accession was varies from 5-16 in two replications. Five selected primers (OPA 4, OPB 07, OPB 17, OPB 18, and OPB 20) were use in analysis. The results showed that the of twenty accessions showed diversity morphologically and genetically. Accession 1, 4, 5, 7, 10, 12, 14, 18 and 23 had capability to flower without vernalization. Morphological diversity indicated by the diversity coefficient was in range 17.5% -77.58%, and the range of genetic diversity was 16.92 to 46.15% of percentage of polymorphic loci. The results of cluster analysis based on eight morphological characters showed that accessions were divided into two groups at a distance of 70, where is the first group consisted accession A, 3, 7, 2, 4, 20, 6, 22, 12, 19, 11 and second group consisted accession B, 5, 25, 23, 10, 21, 18. Based on the molecular markers, the accession was divided in four groups at a distance of 70, where is group I consisted of accession 20, 21, 22, 23, 25; group II consisted of accessions 11, 12, 14, 18, 19; group III consisted of accessions 4, 5, 6, 10; group IV consisted of accessions A, B, 1, 2, 4. Result of grouping based on morphology different from the results of grouping based on moleculer.

Kata Kunci : wortel, RAPD, morfologi,genetik, analisis klaster