IDENTIFIKASI MOLEKULAR ISOLAT BAKTERI DARI SPONS LAUT PENGHASIL SENYAWA ANTIPLASMODIUM

RANI AFIFAH NUR HESTIYANI, Dr.rer.nat. Yosi Bayu Murti, M.Si., Apt.

2013 | Tesis | S2 Bioteknologi

. Bakteri dari spons laut merupakan salah satu sumber penemuan berbagai metabolit aktif, salah satunya sebagai antiplasmodium Penelitian ini melakukan studi terhadap ekstrak yang dihasilkan bakteri dari spons sebagai antiplasmodium, mengelompokkan bakteri dari spons yang aktif sebagai antiplasmodium dengan Repetitive PCR (Rep-PCR) dan mengetahui jenis bakteri dari spons yang aktif sebagai antiplasmodium berdasarkan analisis gen 16S rRNA serta mengkarakterisasi senyawa penyusun ekstrak aktif antiplasmodium. dan diekstraksi dengan Bakteri yang diperoleh dari spons difermentasi pelarut etil asetat. Ekstrak hasil fermentasi, kemudian diuji aktivitas antiplasmodium dengan uji penghambatan polimerisasi heme dan penghambatan pertumbuhan Plasmodium in vitro. Primer BOXA1R digunakan dalam analisis Rep-PCR, sedangkan primer 27F dan 1385R digunakan dalam analisis gen 16S rRNA pada bakteri yang aktif sebagai antiplasmodium. Karakterisasi senyawa penyusun ekstrak aktif antiplasmodium dilakukan menggunakan liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS). Kata kunci: Sebanyak tujuh ekstrak dari sepuluh ekstrak bakteri diketahui aktif pada uji penghambatan polimerisasi heme. Sebanyak empat ekstrak aktif berpotensi sedang pada uji penghambatan pertumbuhan Plasmodium in vitro, yaitu BYT5C4, BYT7, 102TP, dan BYT5C5 dengan nilai IC50 masing-masing sebesar 22,20±1,09; 32,87±2,55; 41,27±4,11; dan 44,86±15,25 µg/mL. Empat bakteri tersebut terbagi ke dalam tiga kelompok yang berbeda-beda. Bakteri BYT7, 102TP, BYT5C4 dan BYT5C5 masing-masing teridentifikasi sebagai Bacillus firmus, Micrococcus lylae, Brevibacterium casei dan Exiguobacterium profondum. Berdasarkan pola fragmentasi hasil analisis liquid chromatographymass specrometry (LC-MS), senyawa-senyawa dalam ekstrak aktif anti Plasmodium termasuk ke dalam golongan senyawa ketida dan peptida.

Bacteria from sponges are one source of bioactive compounds. One of them is known as an antiplasmodial. This research was conducted to evaluate the antiplasmodial activity of compounds produced by bacteria from sponges, classified among bacteria from sponges were active as antiplasmodial by Rep- PCR, identified the species of bacteria based on the analysis 16S rRNA gene and characterize the compounds of the active extract antiplasmodial. Bacteria fermented and extracted with ethyl acetate which then assesed for heme polymerization inhibition assay and in vitro antiplasmodial activity assay. BOXA1R primer was used to analyze the Rep-PCR, while 27F and 1385R primers were used to analyze the 16S rRNA gen among bacteria were active antiplasmodial. Liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) was used to analyze the compounds of the active extract antiplasmodial Among ten bacteria isolated examined, seven isolates showed good activity in heme polimerization assay. Among them, four isolates i.e BYT7, 102TP, BYT5C4 and BYT5C5 has moderate activity in vitro assay with IC50 value respectively 32,87±2,55; 41,27±4,11; 22,20±1,09 dan 44,86±15,25 µg/mL. The four bacteria isolates were identified as Bacillus firmus, Micrococcus lylae, Brevibacterium casei and Exiguobacterium profundum and they have different groups. The bacteria that active as antiplasmodium have active compound belongs to peptides and ketides class.

Kata Kunci : spons, bakteri dari spons, antiplasmodium, Repetitive PCR, 16S rRNA