DETEKSI PENYEBAB PENYAKIT KERUPUK DAN MOSAIK PADA TEMBAKAU DAN PENGENDALIAN KUTU KEBUL DENGAN BARRIER SYSTEM DI PTPN X (PERSERO), KLATEN

TRI MARUTO AJI, Dr. Ir. Sedyo Hartono, M.P

2012 | Tesis | S2 Fitopatologi

Sejak tahun 2009, terjadi wabah penyakit daun kerupuk pada tanaman tembakau bawah naungan (TBN) di PTPN X (Persero) dan telah menyebabkan penurunan hasil hingga 70%. Gejala penyakit ditunjukkan dengan daun kerupuk dan kerdil seperti infeksi Begomovirus pada terong dan tomat. Kejadian ini berasosiasi dengan tingginya populasi whitefly (Bemisia tabaci). Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi patogen dan cara pengendaliannya menggunakan barier fisik yang dikombinasikan dengan barier biologis sebagai penghalang B. tabaci agar tidak masuk ke lahan. Penelitian dilakukan dengan cara monitoring penyakit tembakau untuk mengetahui intensitas penyakit yang muncul di lahan pertanaman tembakau dan untuk mengoleksi sampel dari tanaman sakit untuk diagnosis lebih lanjut. Untuk mengidentifikasi dilakukan isolasi total DNA dari sampel yang dikoleksi kemudian dilakukan PCR dengan primer Begomovirus yaitu TYLCV 1840F & IL2642R, Krusty & Hommer, dan Pal1v1978 & Par1c496 yang merupakan primer universal untuk Begomovirus. Hasil PCR menunjukkan adanya pita DNA berukuran sekitar 800 bp ketika diamplifikasi menggunakan primer TYLCV 1840F & IL2642R. Hasil PCR dengan primer Krusty & Hommer diperoleh pita DNA sekitar 580 bp dan 650 bp. Hasil PCR dengan primer Pal1v1978 & Par1c496 diperoleh pita DNA sekitar 1600 bp. Identifikasi PCR dengan primer TobRT-up1 dan TobRT-do2 untuk Tobamovirus terhadap cDNA yang dibuat dari hasil ekstraksi dsRNA pada sampel tembakau bergejala mosaik diperoleh pita DNA berukuran sekitar 568 bp. Salah satu produk PCR dari sampel Begomovirus kemudian disekuen dan dianalisis nukleotidanya. Diketahui bahwa gejala kerupuk dan kerdil pada tembakau terinfeksi oleh Tomato Yellow Leaf Curl Virus (TYLCV), anggota genus Begomovirus, dari keluarga Geminiviridae. Analisis dengan BLAST menunjukkan homologi yang tinggi DNA virus yang diperoleh terhadap TYLCV-Kan 1 and TYLCV-Kan 2 isolat dari Thailand. Pada penelitian pengelolaan serangga vektor B. tabaci dilakukan dengan pertanaman barrier system. Adapun perlakuan meliputi tiga macam yaitu : (1) barier fisik dengan kelambu, (2) kombinasi barier fisik dengan barier biologis (tanaman jagung), dan (3) kontrol dengan variasi jenis pestisida. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pengendalian yang efektif diperoleh dengan barier fisik berupa kelambu jenis Organdi yang memiliki mesh tinggi dibanding penggunakan kelambu standar yang bermesh rendah. Kelambu Organdi terbukti dapat menekan populasi vektor dan menurunkan intensitas penyakit dibanding penggunaan kelambu standar PTPN X. Perlakuan kombinasi menunjukkan bahwa barier biologis berupa tanaman jagung tidak efektif mengendalikan B. tabaci namun berguna sebagai tanaman pemecah angin. Perlakuan berbagai jenis pestisida menunjukkan bahwa pestisida yang berbahan aktif Imidacloprid 25 WP lebih efektif mengendalikan populasi B. tabaci dibandingkan dengan pestisida berbahan aktif Dimetoat 400 EC.

Since 2009, the leaf curl disease symptom was observed on tobacco plants under net shadow of PTPN X (Persero) and has caused yield losses up to 70%. The disease was likely to be associated with the existence of high population of the sweet potato-whitefly (Bemisia tabaci) and the symptoms resembled to that reported for Begomovirus infection on eggplant and tomatoes. This study aimed to identify the pathogen and how to control the disease using of physical barriers in combination with a biological barrier to avoid B. tabaci enter the farm. The research was done by surveying tobacco diseases to know the diseases intensity and to collect samples for further laboratory research. To identify the pathogen caused the disease, total DNA was extracted from leaf curl symptom of tobacco, PCR analyses using three primers set TYLCV 1840F&IL2642R, Krusty&Hommer, and Pal1v1978 and Par1c496, the universal primers for Begomovirus. PCR results showed a single DNA band with approx. size of 800 bp when DNA was amplified by PCR using TYLCV 1840F&IL2642R primers, and two DNA bands of approx. size 580bp and 650 bp were obtained using Krusty & Hommer primers, and a 1600 bp DNA band amplified by PCR using TYLCV 1840F&IL2642R. Viral identification using primers TobRT-up1 and TobRT-Do2 for Tobamoviruses revealed a single DNA band with approx. size of 568 bp when cDNA from mosaic symptoms of tobacco was used as a template for PCR. One DNA product of Begomovirus sample was then directly sequenced. Nucleotide sequence analysis showed that leaf curl disease of tobacco is caused by Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV), a member of the Genus Begomovirus, the Family Geminiviridae. BLAST searched revealed a highest DNA homology to TYLCV-Kan 1 and TYLCV-Kan 2 isolates of Thailand. Research for management of insect vectors B. tabaci were done using three methods: (1) Physical barrier using net barrier; (2) combinations of net barrier with biologiacal barrier (corn barrier); and (3) chemical control. The result showed that an effective control was obtained using Net organdy barrier with higher mesh size rather than using Net standard low mesh size commonly used by PTPN X (Persero). It suggests that the Net organdy barrier can reduce vector populations and lower disease intensity comparing with the Net standard commonly used by PTPN X. Corn barrier didn’t give any effective control except as a wind breaker. While chemical treatments using insecticide containing active ingredient of Imidacloprid 25 WP provide more effective in controlling population B. tabaci rather than active ingredient of Dimetoat 400 EC.

Kata Kunci : tembakau, barrier system, B. tabaci, Tobamovirus, Begomovirus