STUDI PERBANDINGAN MORFOLOGI DAN MOLEKULER Lernaeasidae PADA IKAN ARWANA IRIAN (Scleropages jardini) DI INDONESIA
DIKRY NOVEL SHATRIE, Prof. drh. Kurniasih, MV.Sc., Ph.D.
2011 | Disertasi | S3 Sain VeterinerIkan Arwana Irian (Scleropages jardini) adalah salah satu spesies yang terancam punah. Lernaeosis merupakan salah satu penyakit yang dapat menyebabkan angka kematian tinggi pada ikan Arwana muda. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui spesies Lernaea (Copepoda) yang sering menyerang ikan Arwana Irian. Sebanyak 20 sampel Lernaea sp. dikumpulkan dari Merauke (Papua) dan Jakarta (Jawa). Sampel difiksasi dalam glutaraldehyde untuk pemeriksaan morfologi menggunakan Scanning Electron Microscope (SEM) dan sebagian sampel difiksasi dalam etanol absolut untuk pemeriksaan molekuler menggunakan PCR-RFLP (Randomized Fragment Length Polymorphysm) dan sequensing rDNA. Berdasarkan morfologi dan SEM ditemukan 6 spesies Lernaea yang berbeda dan salah satunya dianggap sebagai spesies baru. Hasil PCR-RFLP pada area gen18S dan 28S rDNA terhadap spesies Lernaea tidak menunjukkan perbedaan. Berdasarkan analisis filogenetik pada area ITS1 menunjukkan tiga cluster yang berbeda, yaitu: L. cyprinacea, L. papuensis, L. devastatrix dan L. lophiara berada dalam satu kelompok; L. cyprinacea, L. oryzophila satu kelompok, dan Lernaea sp.n di kelompok yang berbeda.
Arwana Irian fish (Scleropages jardini) is one of endangered species. Lernaeosis is one of the diseases that cause the high mortality in fish juvenile. The objectives of this research was to find out the species of Lernaea (Copepoda) often attacked Arwana Irian fish based on morphology and their phylogenetics relationship. Lernaea sp. was collected from Merauke (Papua) and Jakarta (Java). Some of them fixed in glutaraldehyde for morphology study and fine structure of surface body with Scanning Electron Microscope (SEM) and fine structure of surface body with some of them in ethanol absolute solution for molecular study (Randomized Fragment Length Polymorphysm and sequensing rDNA). It was found 6 different species of Lernaea and one of them were considered as a new species, based on morphology and SEM. Lernaea species had slightly different based on RFLP of DNA in the 18S region using Hae III and Alu I enzyme, DNA sequencing result in 28S rDNA and ITS. Based on the phylogenetics analysis, they showed three different groups. Lernaea cyprinacea G, L. papuensis, L. devastatrix and L. lophiara were in one group; L. cyprinacea and L. oryzophila were in one groups; and the new Lernaea sp.n was in the different group.
Kata Kunci : Scleropages jardini., Lernaeosis, Filogenetik