HIPERMETILASI PROMOTER GEN DKK3, CDH1, DAN APAF1 PADA PASIEN LEUKEMIA LIMFOBLASTIK AKUT ANAK
dr. Ika Fidianingsih, Dra. Dewanjani Purnomosari.,M.Si.,Ph.D.
2011 | Tesis | S2 Ilmu Kedokteran Dasar dan BiomedisLatar Belakang: Hipermetilasi DNA ditengarai berperan penting dalam inaktivasi gen tumor supresor (Tumor Suppressor gene=TSG) pada keganasan hematologi. Beberapa TSG seperti Dickkopfs3(DKK3), E-Chaderin (CDH1) dan Apoptotic protease-activating factor-1 (APAF1) mempunyai frekuensi hipermetilasi cukup tinggi pada leukemia limfoblastik akut (LLA) anak. Hipermetilasi promoter DKK3, CDH1, APAF1 menyebabkan sel progenitor limfoid mengalami proliferasi yang tidak terkendali, metastasis dan gangguan apoptosis. Tujuan Penelitian: Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui frekuensi hipermetilasi promoter DKK3, CDH1, dan APAF1 pada pasien yang terdiagnosis LLA anak di RSUP DR. Sardjito Yogyakarta, serta hubungannnya dengan karakteristik umur, jumlah leukosit dan imunofenotip. Metode: DNA dari 32 sampel mononuklear darah perifer pasien LLA anak dideteksi menggunakan Methylation spesific polymerase chain reaction (MSP). Analisis statistik dilakukan dengan menggunakan uji Fisher Exact. Hasil Penelitian: Hipermetilasi DKK3, CDH1, dan APAF1 terjadi pada 18(56,3%); 19(59,4%), dan 26(81,3%) pasien LLA anak. Pasien LLA anak yang mengalami hipermetilasi DKK3, CDH1, dan APAF1 lebih banyak terjadi pada kelompok umur 1-10 tahun dan jumlah leukosit ≥50 ribu/mmk, tetapi tidak berbeda signifikan dibanding kelompok umur <1 tahun dan >10 tahun serta jumlah leukosit <50 ribu/mmk (berturut-turut p=0,21; 0,54; 0,58; 0,58; 0,11; 0,6). Pasien LLA anak yang mengalami hipermetilasi DKK3, CDH1 dan APAF1 lebih banyak pada imunofenotip B dibanding imunofenotip T dan tidak berbeda signifikan (berturut-turut p=0,54; 0,15) kecuali hipermetilasi DKK3 (p=0,028). Kesimpulan: Hipermetilasi DKK3, CDH1, dan APAF1 tidak berhubungan dengan karakteristik umur, jumlah leukosit dan imunofenotip, kecuali hipermetilasi DKK3 dengan imunofenotip B
DNA hypermethylation plays an important role in the inactivation of cancer related genes in hematological neoplasms. Tumor suppressor genes, such as Dickkopfs3 (DKK3), E-Chaderin (CDH1) and Apoptotic protease-activating factor1 (APAF1) were methylated at relatively high frequencies in chilhood acute lymphoblastic leukemia (ALL). Hypermethylation of DKK3, CDH1 and APAF1 implicated in growth-deregulating events, metastasis and impaired apoptosis. The purpose of this study is to investigate the hypermethylation profile of DKK3, CDH1, APAF1 genes and their correlation with age, leukocyte count and immunophenotype in childhood ALL at DR. Sardjito hospital, Yogyakarta. Genomic DNA from pheripheral blood mononuklaers were obtained from 32 chilhood ALL at the time of diagnosis between October 2004 and May 2009. Hypermethylation were detected using the methylation specific polymerase chain reaction (MSP). Statistical analysis was performed using the Fisher's exact test. DKK3, CDH1 and APAF1 were methylated in 18 (56.3%),19 (59.4%) and 26 (81.3%) childhood ALL respectively. Clinical characteristics including age, leukocyte count and immunophenotype did not show significant correlation with hypermethylation status of DKK3, CDH1, APAF1 except for immunophenotype and DKK3 hypermethylation (p = 0.028).
Kata Kunci : hipermetilasi, DKK3, CDH1, APAF1, LLA