Fusi gena Tel-Aml1, BCR-ABL, E2A-PBX1 dan MLL-Af4 sebagai faktor prognosis leukemia limfoblastik akut

MULATSIH, Sri, Promotor Prof. DR. dr. Sutaryo, Sp.AK

2010 | Disertasi | S3 Ilmu Kedokteran

Kemajuan ilmu dan teknologi kedokteran terkini telah sangat berperan dalam menentukan indikator prognosis berbasis genetika molekular terhadap luaran penderita LLA. Sampai dewasa ini hubungan antara fusi gena TEL-AML1, BCR-ABL tipe LLA dan E2A-PBX1 dengan luaran terapi penderita LLA anak masih merupakan kontroversi. Gena-gena tersebut sebagian besar merupakan faktor transkripsi ataupun tirosin kinase. Pada tingkat selular fusi gena tersebut akan mempengarui kerja faktor transkripsi maupun tirosin kinase dari masing-masing pasangannya, dengan akibat gangguan proses self renewel, proliferasi dan diferensiasi sel hematopoeitik. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui angka kejadian fusi gena TEL-AML1, BCR-ABL tipe LLA, E2A-PBX1, dan MLL-AF4 dan mempelajari pengaruh usia, jumlah leukosit, stratifikasi risiko, fusi gena pada awal diagnosis terhadap kejadian relaps, kematian serta event free survival (EFS) dan relapse free survival (RFS) pada penderita LLA anak. Penelitian nested case-control ini dilakukan pada penderita LLA anak yang masuk kriteria inklusi dan mendapat kemoterapi periode Nopember 2003 sampai dengan Maret 2009. Teknik Nested RT-PCR digunakan untuk melihat empat macam fusi gena tersebut. Dari 56 sampel, 28 (50%) kelompok kasus (meninggal dan relaps) dan 28 (50%) kelompok kontrol. Dari sejumlah 56 sampel DNA yang diperiksa terdapat 24 (43%) sampel positif mengalami fusi gena dan 32 (57%) negatif (normal) (dari kelompok kasus dan kontrol). Dari 24 penderita tersebut 13 (23%) terjadi fusi gena TEL-AML1, 6 (11%) BCR-ABL tipe LLA, 5 (9%) E2A-PBX1, sedangkan fusi gena MLL-AF4 tidak ditemukan. Berdasarkan analisis multivariat ditemukan bahwa penderita dengan TELAML1- positif memiliki risiko 8 kali lebih tinggi terjadi kematian dan/atau relaps dengan OR: 7,658 [1,400-41,900] (P=0,019). Dengan median pengamatan 3,4 tahun, penderita dengan fusi gena TEL-AML1 memiliki EFS lebih rendah (10,9%) dibanding yang tidak memiliki fusi gena tersebut (46,9%) (P=0,019) dan angka RFS juga lebih rendah secara bermakna (17%) dibanding penderita yang tidak mempunyai fusi gena tersebut (56,8%) (P=0,037). Setelah distratifikasi menurut kelompok risiko, hasil ini tetap bermakna. Disimpulkan bahwa angka kejadian fusi gena yang terbanyak adalah TEL-AML1, diikuti BCR-ABL tipe LLA, dan E2A-PBX1. Fusi gena MLL-AF4 tidak ditemukan pada penelitian ini. Gambaran profil fusi gena ini merupakan yang pertama kali dilaporkan di Indonesia. Fusi gena TEL-AML1-positif pada awal diagnosis secara klinis memiliki risiko kematian dan/atau relaps lebih tinggi serta nilai EFS dan RFS lebih rendah dibanding yang negatif baik kelompok risiko tinggi maupun rendah. Nilai EFS di antara penderita dengan fusi gena TEl-AML1, BCR-ABL tipe LLA, dan E2A-PBX1 tidak berbeda bermakna.

The advances of knowledge and medical technology have been contributed in deciding prognostic indicator, which based on genetics, molecular for outcome of treatment of acute lymphoblastic leukemia (ALL) patients. At recent, correlation between TEL-AML1, BCR-ABL ALL type, and E2A-PBX1 gene fusions and outcome of treatment ALL patients are still controversy. Most of these genes are as a transcription factors or tyrosine kinase. In cellular level, this gene will influence work of transcription factors and tyrosine kinase of their pairs, which lead to disturbance of self-renewal, proliferation, and differentiation of haematopoeitic cell. The aims of this research were to explore the incidence TEL-AML1, BCR-ABL ALL type, E2A-PBX1, and MLL-AF4 gene fusions at diagnosis influence of age, leukocyte count, risk stratification, and those gene fusion to the relapse and/or mortality rate, event free survival (EFS), and relapse free survival (RFS) in childhood ALL. This nested case-control study had been done for childhood ALL that were included in inclusion criteria and received chemotherapy during November 2009 to March 2009. Nested RT-PCR was performed to examine those gene fusions. From 56 patients, 28 (50%) were cases (dead and/or relapse) and 28 (50%) were control group. From 56 DNA samples 24 (43%) were positive gene fusion and 32(57%) normal/ no gene fusion. This study showed the percentage of TEL-AML1-positive was 13 (23%), BCR-ABL ALL type was 6 (11%), and E2A-PBX1 was 5 (9%), while MLLAF4 was not find in this study. From multivariate analysis patients with TEL-AML1- positive had 8 times higher to develop relapse and/or dead with OR: 7.658 [95% CI: 1.400 – 41.900], P= 0.019. At 3.4 years median follow up, EFS patient with TEL-AML1- positive was lower (10.9%) compared with TEL-AML1-negative (46.9%) (P=0,019), while in the same median follow up RFS was significantly lower (17%) in TEL-AML1- positive group compared with TEL-AML1-negative (56.8%) (P=0,037). The same result after it was analyzed based on risk group. In conclusion, the most frequent gene fusion is TEL-AML1, followed by BCRABL ALL type, and E2A-PBX1. MLL-AF4 gene fusion is not found in this research. This is the first report concerning gene profiling in childhood ALL in Indonesia. Patients with TEL-AML1-positive at diagnosis is conclusive had higher relapse and/dead and lower EFS and RFS compared with TEL-AML1-negative.

Kata Kunci : Fusi gena TEL-AML1,BCR-ABL tipe LLA,E2A-PBX1,Leukemia