Kajian keragaman kultivar salak di Jawa berdasarkan penanda morfologi dan RAPD

NANDARIYAH, Promotor Prof.Dr.Ir. Soemartono

2007 | Disertasi | S3 Ilmu Pertanian

Pulau Jawa adalah salah satu pusat keragaman genetik tanaman salak (Salacca zalacca (Gaertner (Voss) yang mempunyai potensi cukup besar dan belum digali untuk menghasilkan varietas unggul. Informasi genetik yang lengkap diperlukan pemulia untuk memudahkan perakitan keragaman genetik tanaman salak menjadi varietas baru. Penelitian ini mengkaji keragaman genetik kultivar salak yang terdapat di sentra-sentra produksi di pulau Jawa berdasarkan penanda morfologi dan RAPD. Penelitian bertujuan untuk 1) Mengetahui perbedaan hasil klasifikasi tanaman salak berdasarkan penanda morfologi dan RAPD, 2) mengetahui keragaman di dalam dan antar populasi salak berdasarkan penanda RAPD, 3) mendapatkan penanda morfologi dan molekuler penentu sifat unggul salak, 4) menentukan kultivar unggul yang dapat digunakan sebagai tetua dalam persilangan antar kultivar salak. Bahan penelitian adalah populasi tanaman salak kultivar Manonjaya (Jawa Barat), Banjarnegara, Bejalen, Saratan dan Lawu (Jawa Tengah), Gading, Kembangarum, Pondoh Hitam, Pondoh Super, Manggala dan Madu (Sleman- D.I.Yogyakarta) dan Suwaru (Malang-Jawa Timur). Setiap kultivar diamati 10 contoh tanaman dan juga 10 contoh daun untuk analisis RAPD. Keragaman karakter morfologi yang dipelajari adalah tinggi tanaman, jumlah daun, jumlah duri, panjang duri, lebar pucuk daun, warna daun, warna duri, warna kulit buah, warna daging buah, tebal buah, berat buah, berat biji, kadar gula, kadar tanin buah, kadar tanin daun, sifat duri di bagian punggung daun, sifat ujung daun nglinting, pola kulit buah lurik dan cairan buah seperti madu. Analisis keragaman dan klasifikasi kultivar secara molekuler menggunakan teknik RAPD dengan enam jenis primer acak: OPA-11, OPA-17, OPA-18, OPX-15, dan OPX-17 yang diseleksi dari 27 jenis primer acak 10-mer. Hasil klasifikasi menunjukkan perbedaan pengelompokan pada klasifikasi tanaman salak berdasarkan penanda morfologi dan RAPD. Pengelompokan kultivar salak berdasarkan penanda morfologi membagi 12 kultivar salak kedalam 4 kelompok: 1) Manonjaya, Manggala, Suwaru dan Kembangarum 2), Pondoh super, Pondoh hitam 3) Banjarnegara, Saratan dan Bejalen, 4) Gading, Madu dan Lawu. Pengelompokan kultivar salak berdasarkan RAPD juga membagi 12 kultivar ke dalam 4 kelompok: 1) Pondoh super, Banjarnegara, Pondoh hitam, Gading, Kembangarum dan Suwaru; 2) Bejalen, Saratan dan Lawu, , 3) Madu dan Manggala 4) Manonjaya. Pengelompokan menunjukkan pemisahan antara kelompok tanaman salak pondoh. Hasil pengelompokan kultivar berdasarkan penanda morfologi dan molekuler menunjukkan kekerabatan sangat dekat pada beberapa kultivar yaitu: Bejalen, dan Saratan asal Jawa Tengah serta salak Pondoh hitam dan Pondoh super asal Sleman Yogyakarta. Hasil analisis keragaman berdasarkan penanda RAPD menggunakan software Pop.Gen 1.32 menunjukkan adanya keragaman genetik dalam dan antar populasi salak. Penanda RAPD OPA 111100, OPA-173000, OPA-11750, OPX-17750 dan OPA-18350 adalah penanda molekuler yang banyak berkorelasi dengan penanda morfologi tanaman salak.Terdapat penanda morfologi penentu keunggulan tanaman yang dinyatakan dalam daya hasil (berat buah) dan berkorelasi dengan penanda RAPD yaitu: tinggi tanaman, jumlah daun per pelepah dan lebar daun pucuk (“totok”). Kultivar salak yang memiliki keunggulan spesifik dan dapat digunakan dalam persilangan antar kultivar adalah: Madu, Pondoh super dan Gading.

Java as a center variability of salak (Salacca zalacca (Gaertner (Voss) has a big potential to raise high yielding varieties for more competitive and economic. Complete information is hardly needed and it will be easier to make new varieties from this genetic variability.This study on genetic variability of salak plants, in the centres of population in Java island aimed (1) to know the difference of classification based on morphological and RAPD markers,(2) to know the genetic diversity among salak cultivars based on RAPD marker, (3) to decide morphological and molecular markers that could be useful in early selection for superior characteristics in plant breeding programs of salak, (4) to decide cultivars as material in breeding program. The research materials were salak plants population of Manonjaya (West Java), Banjarnegara, Bejalen, Saratan and Lawu (Central Java), Gading, Kembangarum, Pondoh Hitam, Pondoh Super, Manggala and Madu (Sleman – Yogyakarta) and Suwaru (Malang – East Java). Each cultivar was observed 10 samples, also have been used for RAPD analysis. The morphological characteristic observed were: plant height, total leaflets, total thorns, thorns length, width of point leaflets, leaflet color, thorns color, skin color, fruits weight, seed weight, flesh color, thickness of flesh, sugar contents, tannin contents, abaxial thorns, curved type of point leaflet, flesh liquid as honey, strips skin types. Analysis of RAPD used 6 random primers: OPA-11, OPA-16, OPA-17, OPA-18, OPX-15, and OPX-17 which had been selected from 27 random primers 10-mer. The results of research showed difference result of clustering analysis based on morphological and RAPD markers. Cultivars salak plant was divided morphological classification of four groups: 1) Manonjaya, Manggala, Suwaru and Kembangarum 2), Pondoh super, Pondoh hitam 3) Banjarnegara, Saratan and Bejalen, 4) Gading, Madu and Lawu. Cultivars clustering based on RAPD markers also devided the cultivars of 4 clusters: 1) Pondoh super, Banjarnegara, Pondoh hitam, Gading, Kembangarum and Suwaru; 2) Bejalen, Saratan and Lawu, , 3) Madu and Manggala 4) Manonjaya. This cluster showed separation of pondoh cultivar. Analysis RAPD by Pop. Gen. 1.32 software showed the genetic diversity among Java salak cultivars. The results of research showed the difference classification of cultivars salak in Java based on morphological and molecular (RAPD) markers although some of cultivars showed the genetic similarity such as Bejalen and Saratan original from Central of Java; Pondoh super and Pondoh hitam cultivars original from Sleman Yogyakarta. RAPD markers were: OPA-111100, OPA-173000, OPA-11750, OPX-17750 and OPA-18350 most correlated with morphological marker which can be used to assist accelerated selection of superior characteristic of salak plant. Three morphological markers determine of fruit production were plant height, number of leaflet and wide of point leaflet. There were three cultivars showed superior characters which can be used as parent in cross breeding of salak plant: Pondoh super, Madu and Gading.

Kata Kunci : Tanaman Salak,Keragaman Kultivar,Penanda Morfologi dan RAPD