Analisis molekuler tapak pelekatan reseptor fragmen gen hemagglutinin virus Avian Influenza H5N1 yang diisolasi dari unggas asal Purworejo, Jawa Tengah dan Bantul, Yogyakarta

GARJITO, Triwibowo Ambar, Prof.drh. Widya Asmara, SU.,Ph.D

2007 | Tesis | S2 Ilmu Kedokteran Tropis (Imunologi dan Biologi M

Dalam penelitian ini telah dilakukan analisis molekuler terhadap tapak pelekatan reseptor pada segmen gen Hemagglutinin Virus Avian Influenza H5N1 yang berasal dari isolat asal entog yang berasal dari Bantul, Yogyakarta dan ayam yang berasal dari Purworejo, Jawa Tengah. Untuk mengidentifikasi kemungkinan terjadinya perubahan (mutasi) susunan nukleotida dan asam aminonya, analisis dilakukan dengan membandingkan suatu bagian urutan nukleotida pada segmen HA1 dari gen HA dengan virus H5N1 lainnya asal unggas maupun manusia yang berasal dari kawasan Asia, Eropa dan Afrika pada periode waktu antara 1997 – 2007. Hasil penelitian terhadap residu asam amino pada tapak pelekatan reseptor dari kedua isolat uji menunjukkan adanya kesamaan dengan isolat virus H5N1 asal unggas maupun manusia dari Indonesia. Analisis filogenetik juga telah dilakukan dengan membandingkan kedua isolat uji tersebut dengan 57 isolat virus Avian Influenza H5N1 asal manusia dan unggas lainnya. Kedua isolat tersebut menunjukkan kecenderungan termasuk dalam clades 2 dengan adanya substitusi asam amino yang unik pada posisi 133 (Serine menjadi Leucine) dan posisi 160 (Alanine menjadi threonine). Perubahan ini berdampak pada pelekatan reseptor, hal ini dikarenakan S133 akan membuat kontak atom dengan sialoside seluler pada reseptor, sedangkan substitusi A160T diperkirakan akan dapat menyebabkan afinitas terhadap sialosides menjadi menurun. Secara keseluruhan menunjukkan bahwa karakteristik molekuler segmen gen dari isolat Virus Avian Influenza H5N1 asal entog, Bantul dan ayam, Purworejo masih memiliki residu asam amino pada tapak pelekatan reseptor yang umum dijumpai dengan kecenderungan masih lebih mengenali sialic-acid galactose yang terdapat pada unggas dibandingkan pada manusia. Hal ini ditunjukkan dari hasil analisis dimana tidak terjadi point mutation yang signifikan pada daerah tersebut

The receptor binding sites of the Hemagglutinin genes segment of Avian Influenza virus H5N1 from Muscovy duck isolate in Bantul, Yogyakarta and Chicken isolate in Purworejo, Central Jawa were analyzed. To identify possible nucleotide and amino acid changes, the analysis were conducted by comparing their partial nucleotides sequences in the HA1 regions of the HA gene with others H5N1 viruses that were isolated in different countries of Asia, Europe and Africa during 1997 to 2007. The result showed that amino acid residues at the receptor binding site of the two isolates tested were similar to those of the chickens and human H5N1 viruses from Indonesia. Phylogenetic analysis were performed in comparison to AI virus from that isolates tested with 57 others H5N1 isolates reported during 1997 to 2007. Both of them belonged to a clades 2 with the unique amino acids substitution at the position 132 (serine to leucine) and 160 (Alanine to threonine). These changes affect receptor binding, because S133 makes atom contact with cellular sialoside receptors. In addition, the A156T substitution is predicted to reduce its affinity for sialocides. Molecular characterization of gene segment of Bantul and Purworejo isolates revealed common characteristics of the receptor binding sites residues which contained more avian-spesific residues. From this analysis showed that there were no significant point mutations in critical regions

Kata Kunci : Virus Avian Influenza,H5N1,Tapak Pelekatan Reseptor, Receptor binding sites, Avian Influenza Virus; H5N1