Perbedaan genetik dan virulensi bakteri penyebab peyakit darah pada pisang

EDY, Nur, Dr.Ir. Siti Subandiyah, M.Agr.Sc

2006 | Tesis | S2 Fitopatologi

Penyakit darah pada pisang masih menjadi masalah penting di Indonesia. Bakteri penyebab penyakit darah (Blood Disease Bacterium, BDB) mempunyai sebaran yang luas dan sampai saat ini hanya ditemukan di Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari karakter genetik dan virulensi BDB. Isolasi bakteri dilakukan dari beberapa daerah di Indonesia. Karakterisasi bakteri dilakukan dengan pengamatan morfologi, uji biokimia, uji patogenisitas dan deteksi spesifik dengan Polymerase Chain Raection menggunakan primer 121 R/F. Keragaman genetik dianalisa dengan rep-PCR menggunakan primer BOXA1R, masing- masing satu isolat dari kelompok genetik berbeda dipilih untuk mempelajari virulensinya pada pisang Raja dan Kepok dengan metode invectivyty tiytration. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 21 isolat BDB memiliki karakter morfologi dan biokimia yang sama. Uji patogenisitas menunjukkan bahwa BDB hanya menginfeksi pisang tetapi tidak pada tomat, cabai, dan terung. Analisa rep-PCR menghasilkan tiga kelompok genetik berbeda. Hasil uji virulensi menunjukkan isolat HE-32 (asal Palu) memiliki tingkat virulensi tertinggi disusul isolat HE-29 (asal lampung) dan isolat HE-03 (asal sleman) secara berturut-turut.

Blood disease of banana affective by blood disease bacterium is the most important banana disease with wide spread and only find in Indonesia. The aims of this research are to study the genetic differentiation and virulence of blood disease bacteria on banana and plantain. Morphology, biochemical, pahogenicity assay and rapid detection by Polymerase Chain Reaction using 121 R/F primers were conducted to determine the BDB. Rep-PCR using primer BOXA1R was used to study the diversity of BDB isolates. One isolate from each different DNA banding pattern were used to study the virulence on Banana cv. Raja and plantain cv. Kapok using infectivity titration method. The results showed that 21 isolates of BDB has similar characteristic. Pathogenicity assay in some plants showed that the bacteria were only affective on banana but not on tomato, pepper, and eggplant. Characterization in molecular level using PCR method with specific primers 121F/R showed that all isolates tested were positively BDB. Based on the rep-PCR data, there were 3 clusters isolate showed genetic differentiation. The virulence assays showed that the most virulent was isolate Plu-32 originated from Palu, Central Sulawesi followed those isolate Lpg-29 from Lampung, Sumatera and isolate Sln-03 from Sleman, Yogyakarta.

Kata Kunci : Penyakit Tanaman Pisang,Penyakit Darah,Bakteri, Blood disease bacterium, characterisation, molecular detection, genetic differentiation, virulence