Uji Perbandingan Aktivitas Litik Bakteriofaga Tunggal dan Koktail Pada Isolat Escherichia coli Resisten Antibiotik yang Diisolasi Dari Lingkungan Domestik

Dewi Nindya Rizky, Dr.rer.nat. Abdul Rahman Siregar, S.Si., M.Biotech.

2026 | Skripsi | BIOLOGI

Resistensi antibiotik pada Escherichia coli menjadi permasalahan yang mendorong pengembangan alternatif pengendalian bakteri, salah satunya menggunakan bakteriofaga. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi isolat E.coli dari sampel lingkungan domestik; menguji dan mengamati isolat-isolat E.coli resisten dari lingkungan domestik dengan uji profil antibiotik; menguji isolat-isolat E.coli  dari lingkungan domestik terhadap aktivitas litik bakteriofaga tunggal dan koktail; membandingkan aktivitas litik bakteriofaga tunggal dan koktail terhadap isolat E.coli yang resisten antibiotik. Isolasi dan identifikasi E. coli dilakukan dari berbagai sampel lingkungan domestik, kemudian profil resistensi antibiotik (ampisilin, siprofloksasin dan tetrasiklin) dan ditentukan menggunakan metode difusi cakram. Aktivitas litik bakteriofaga (faga) dianalisis melalui uji rentang inang (spot test) dan uji perbandingan aktivitas litik faga tunggal dan koktail pada isolat air limbah domestik sebagai indikator kultur inang. Hasil penelitian menunjukkan bahwa beberapa isolat E. coli memiliki sifat resisten terhadap antibiotik dan bakteriofaga tunggal maupun koktail mampu melisis isolat target dengan tingkat efektivitas yang berbeda. Sebaliknya, isolat ECKS, ECAM dan ECKN tidak mengalami lisis pada semua perlakuan (-), yang tidak menunjukkan sensitivitas terhadap faga pada kondisi percobaan yang digunakan. Pada isolat ECSK, fag SAV dan SCV  menimbulkan lisis lemah (+), sedangkan faga SBV, SEV dan faga koktail menghasilkan lisis parsial (++). Secara umum, bakteriofaga koktail menunjukkan jangkauan aktivitas litik lebih luas dibandingkan bakteriofaga tunggal. Dengan demikian, bakteriofaga berpotensi dikembangkan sebagai agen biokontrol terhadap E.coli resisten antibiotik yang berasal dari lingkungan domestik. 

Antibiotic resistance in Escherichia coli has become a major concern, prompting the development of alternative strategies for bacterial control, one of which is the use of bacteriophages. This study aimed to isolate and identify E. coli isolates from domestic environmental samples; to examine and characterize antibiotic-resistant E. coli isolates through antibiotic susceptibility profiling; to evaluate the lytic activity of single and cocktail bacteriophages against E. coli isolates from domestic environments; and to compare the lytic activity of single and cocktail bacteriophages against antibiotic-resistant E. coli isolates. E. coli isolation and identification were performed using various domestic environmental samples, followed by antibiotic susceptibility testing against ampicillin, ciprofloxacin, and tetracycline using the disk diffusion method. Bacteriophage lytic activity was assessed through host range analysis (spot test) and comparative evaluation of single and cocktail phage lytic activity using domestic wastewater isolates as host culture indicators. The results showed that several E. coli isolates exhibited antibiotic resistance, and both single and cocktail bacteriophages were able to lyse the target isolates with varying degrees of effectiveness. In contrast, isolates ECKS, ECAM, and ECKN showed no lysis under any treatment (-), indicating resistance to the bacteriophages used. In isolate ECSK, phages SAV and SCV produced weak lysis (+), whereas phages SBV, SEV, and the phage cocktail resulted in partial lysis (++). Overall, the bacteriophage cocktail exhibited a broader lytic activity spectrum than individual bacteriophages. Therefore, bacteriophages have potential to be developed as biocontrol agents against antibiotic-resistant E. coli originating from domestic environments.

Kata Kunci : Escherichia coli, resistensi antibiotik, koktail bakteriofaga, aktivitas litik, lingkungan domestik.