Identifikasi Keanekaragaman Mamalia dan Herpetofauna Berdasarkan Analisis Environmental DNA (eDNA) di Danau Semayang, Kaskade Mahakam

Nur Baehaki Romadhon, Dr. Dwi Sendi Priyono, S.Si., M.Si.

2026 | Skripsi | BIOLOGI

Danau Kaskade Mahakam (DKM) merupakan kawasan perairan yang memiliki fungsi ekologis krusial bagi berbagai kelompok fauna, termasuk mamalia dan herpetofauna. Pemantauan biodiversitas di kawasan ini sering kali terkendala oleh keterbatasan metode konvensional yang bersifat invasif dan membutuhkan waktu lama, sehingga diperlukan pendekatan molekuler yang lebih efisien seperti environmental DNA (eDNA). Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keanekaragaman mamalia dan herpetofauna di DKM menggunakan pendekatan metode eDNA. Sampel air diambil di kawasan DKM, diikuti dengan proses ekstraksi DNA, amplifikasi gen target, dan analisis bioinformatika untuk mengidentifikasi taksa yang terdeteksi. Hasil penelitian menunjukkan terdeteksinya berbagai ordo, famili, dan genus dari kelompok mamalia dan herpetofauna di area penelitian. Temuan ini mengindikasikan komponen fauna tertentu sebagai bagian yang menyusun struktur komunitas di DKM, yang merefleksikan karakteristik lingkungan perairan dan interaksi habitat di kawasan tersebut. Penelitian ini membuktikan bahwa metode eDNA cukup efektif dalam mendeteksi jejak genetik fauna di DKM, serta menegaskan pentingnya implementasi pemantauan berbasis molekuler sebagai basis data yang akurat untuk mendukung strategi pengelolaan kawasan dan konservasi biodiversitas danau secara berkelanjutan.

The Mahakam Cascade Lake is an aquatic area that serves a crucial ecological function for various groups of fauna, including mammals and herpetofauna. Biodiversity monitoring in this area is often hampered by the limitations of conventional methods, which are invasive and time-consuming; therefore, a more efficient molecular approach such as environmental DNA (eDNA) is required. This study aims to identify the diversity of mammals and herpetofauna in the Mahakam Cascade Lake using the eDNA method. Water samples were collected in the Mahakam Cascade Lake area, followed by DNA extraction, target gene amplification, and bioinformatics analysis to identify the detected taxa. The results indicated the detection of various orders, families, and genera from the mammal and herpetofauna groups in the study area. These findings suggest that certain fauna components play a role in shaping the community structure within the DKM, reflecting the characteristics of the aquatic environment and habitat interactions in the region. This study demonstrates that the eDNA method is effective enough in detecting genetic traces of fauna in the DKM, and underscores the importance of implementing molecular-based monitoring as an accurate data source to support sustainable lake biodiversity conservation and area management strategies.

Kata Kunci : Danau Kaskade Mahakam, eDNA, keanekaragaman mamalia dan herpetofauna