ANALISIS POLIMORFISME GEN KISS1 TERHADAP LITTER SIZE KAMBING PERANAKAN ETTAWA BERKEPALA HITAM DAN COKELAT DI KABUPATEN KULON PROGO

Agatha Evangelista Crisanty, Prof. Dr. drh. Aris Haryanto, M. Si.

2026 | Skripsi | KEDOKTERAN HEWAN

Kambing Peranakan Ettawa (PE) merupakan salah satu kambing lokal hasil persilangan kambing Ettawa dan kambing Kacang yang memiliki produktivitas reproduksi yang cukup baik. Produktivitas kambing PE dapat dipengaruhi oleh faktor genetik, salah satunya gen KISS1 yang berperan dalam pengaturan reproduksi stimulasi pelepasan Gonadotropin Releasing Hormone (GnRH), yang selanjutnya memengaruhi sekresi Luteinizing Hormone (LH) dan Follicle Stimulating Hormone (FSH). Variasi genetik pada gen KISS1 berhubungan dengan performa reproduksi, termasuk litter size pada kambing. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi polimorfisme gen KISS1 pada kambing PE berkepala hitam dan berkepala cokelat di Kabupaten Kulon Progo serta mengevaluasi variasi nukleotida yang ditemykan berdasarkan jumlah litter size. Delapan sampel yang mewakili variasi litter size, warna kepala, dan hasil amplifikasi PCR yang optimal digunakan untuk analisis sequencing DNA metode Sanger. Hasil amplifikasi menunjukkan terbentuknya fragmen DNA gen KISS1 sepanjang 1043 bp. Analisis sekuens menggunakan perangkat lunak MEGA 12 menghasilkan panjang sekuens 599 bp dan menunjukkan adanya 590 situs monomorfik, 9 situs polimorfik, 4 situs singleton, dan 5 situs parsimony informative. Variasi nukleotida ditemukan pada situs 1441, 1587, 1677, 1753, 1776, 1806, 1827, dan 1857. Komposisi rata-rata basa nukleotida pada gen KISS1 terdiri dari timin (22,4%), sitosin (28,8%), adenin (24,5%), dan guanin (24,4,%). Sampel dengan litter size lebih tinggi menunjukkan adanya variasi nukleotida yang berbeda dibandingkan dengan sampel dengan litter size lebih rendah. Hasil penelitian ini menunjukkan adanya polimorfisme pada gen KISS1 kambing PE yang berpotensi dimanfaatkan menjadi informasi dasar dalam pengembangan program seleksi reproduksi berbasis penanda molekuler.

Peranakan Ettawah (PE) goats are one of the Indonesian local goat breeds resulting from a cross between Ettawah goats and Kacang goats, known for their good reproductive performace. Reproductive performance in PE goats can be influenced by genetic factors, one of which is the KISS1 gene that involved in reproductive regulation through the stimulation of Gonadotropin Releasing Hormone (GnRH) secretion, which subsequently influences Luteinizing Hormone (LH) and Follicle Stimulating Hormone (FSH) release. Genetic variation in the KISS1 gene has been associated with reproductive performance, including litter size in gotas. This study aimed to identify KISS1 gene polymorphism in black-headed and brown-headed PE goats from Kulon Progo Regency and to evaluate nucleotide variations based on litter size. Eigth samples representing different litter sizez, head colour phenotypes, and optimal PCR amplification successfully produced a DNA fragment of1043 bp. Sequence analysis using MEGA 12 software generated sequence length of 599 bp and revealed 590 monomorphic sites, 9 polymorphic sties, 4 singleton sites, and 5 parsimony informative sites. Nucleotide information were identified at 1441, 1587, 1677, 1743, 1753, 1776, 1806, 1827, and 1857. The average composition of the KISS1 gene consisted of thymine 22,4%), cytosine (28,8%), adenine (24,5%), dan guanine (24,4%). Samples with higher litter size showed different nucleotide variations compared with the lower litter size. These findings indicate the presence of polymorphism in the KISS1 gene of PE goats and provide preliminary information of the development of molecular marker-assisted selecti9on programs aimed at improving reproductive performance.

Kata Kunci : gen KISS1, kambing Peranakan Ettawa, litter size, Polymerase Chain Reaction, Single Nucleotide Protein / KISS1 gene, litter size, Pernakan Ettawah goats, Polymerase Chain Reaction, Single Nucleotide Protein