Analisis Keanekaragaman Genetik Ulat Sutera Liar Antheraea dari Tanaman Kersen (Muntingia calabura, 1753) di Daerah Istimewa Yogyakarta Berdasarkan Gen Cytochrome Oxidase I (COI)

Adi Citra Prima Pranata, Sukirno, S.Si., M.Sc., Ph.D.

2026 | Skripsi | BIOLOGI

Indonesia menyediakan berbagai wilayah yang cocok dijadikan sebagai habitat bagi ulat sutera liar Antheraea (Hübner, 1819), dengan kondisi iklim yang tropis dan didukung oleh tersedianya hutan heterogen yang lembab, seperti di Daerah Istimewa Yogyakarta (DIY). Penelitian mengenai kelimpahan dan keragaman ulat sutera liar genus ini di DIY belum pernah dilakukan. Hal ini penting dilakukan sebagai pengembangan database gen COI yang lebih komprehensif sehingga mampu menjadi landasan bagi upaya konservasi Antheraea. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman genetik Antheraea di DIY dengan gen COI. Penelitian ini menggunakan metode PCR dengan primer universal gen COI melalui tahapan sampling, ekstraksi DNA, uji kuantitas dan kemurnian DNA, amplifikasi DNA, elektroforesis, gel documentation dan sekuensing. Hasil penelitian ini kemudian dianalisis dengan program GeneStudio, BLAST, MESQUITE, MEGA, dan DnaSP. Berdasarkan hasil penelitian, sampling Antheraea ditemukan pada pohon Muntingia calabura yang terletak di berbagai titik di DIY dalam kisaran elevasi 20-450 mdpl. Antheraea yang teridentifikasi di DIY adalah spesies Antheraea jana. Tidak ditemukan adanya keanegaraman genetik pada data sampel di DIY, yaitu hanya terdapat 1 haplotype dari panjang fragmen 558 bp dengan 0 situs variabel dan parsimony. Nilai keragaman haplotype adalah 0,000 dan keragaman nukelotida adalah 0,000. Jarak genetik antar sampel sebesar 0,00. Semua hasil ini memperkuat jika sampel yang diambil bersifat identik secara genetik. Analisis filogenetik menunjukkan Antheraea jana dari DIY serta Antheraea yang berasal dari Sumatera Barat, Jawa Barat, dan Jawa Timur berada dalam satu clade yang sama dengan nilai 1000 bootstrap tetapi berpisah dengan Antheraea jana dari NTB dan Bali. Penelitian ini diharapkan dapat dijadikan dasar bagi pengembangan database gen COI yang dapat berguna sebagai landasan konservasi ulat sutera liar Antheraea di Indonesia, khususnya Daerah Istimewa Yogyakarta.

Indonesia provides various regions suitable as habitats for wild silkworms of the genus Antheraea (Hübner, 1819), with a tropical climate and supported by the availability of humid heterogeneous forests, such as in the Special Region of Yogyakarta (DIY). Studies regarding the genetic diversity of wild silkworms in DIY have never been conducted. Research related to the genetic diversity of wild silkworms using a more comprehensive COI gene approach is expected to serve as a basis for conservation efforts of Antheraea. Therefore, this study aimed to determine the genetic diversity of wild silkworms in DIY using the COI gene. This research employed the PCR method with universal COI gene primers through several stages, including sampling, DNA extraction, DNA quality and quantity testing, DNA amplification, electrophoresis, gel documentation, and sequencing. The obtained data were then analyzed using the programs GeneStudio, BLAST, MEGA, and DnaSP. The results showed that the sampled Antheraea can be found in Muntingia calabura tree around DIY between elevation range from 20 to 450 meters above sea level. Furthermore, the Antheraea species identified in DIY was Antheraea jana. However, no genetic diversity was found in the sampled population in DIY, indicated by the presence of only one haplotype along the 558 bp fragment with 0 variable sites and 0 parsimony-informative sites. Subsequently, the haplotype diversity and nucleotide diversity values were both 0.000. The genetic distance among samples was 0.00. All these results shows that the samples have similar genetic identity. Phylogenetic analysis indicated that Antheraea jana from DIY formed a clade with Antheraea jana from Sumatra Barat, Java Barat, and Java Timur within the same species branch with a bootstrap value of 100 and formed a different clade with the same species from NTB and Bali. This study is expected to contribute as foundational data for the development of a COI gene database related to wild silkworm conservation of Antheraea in Indonesia, particularly in the Special Region of Yogyakarta.

Kata Kunci : Antheraea, gen COI, keragaman genetik