Analisis Filogenetik dan Sejarah Evolusi Nuri Talaud Eos histrio (Muller, 1776) berdasarkan Marker ND2 DNA Mitokondria

Gita Wilona Silitonga, Dr. Dwi Sendi Priyono S.Si., M.Si.

2026 | Skripsi | BIOLOGI

Burung nuri talaud (Eos histrio) merupakan spesies endemik terancam punah yang populasinya terus menurun secara signifikan akibat perburuan dan perdagangan satwa ilegal. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis struktur filogenetik dan tingkat variasi genetik E. histrio apabila dibandingkan dengan spesies lain pada genus Eos berdasarkan marka mitokondria ND2. Pengambilan spesimen dilakukan dari sampel darah, organ, dan bulu, lalu dilanjutkan dengan proses amplifikasi PCR serta sekuensing. Data dianalisis menggunakan pendekatan Bayesian Inference (BI) untuk rekonstruksi pohon filogenetik dan estimasi waktu divergensi, serta metode Bayesian Skyline Plot (BSP) untuk menelusuri sejarah fluktuasi demografi populasi. Hasil penelitian menunjukkan sekuens target didominasi oleh konten nukleotida bias A+T dengan nilai rata-rata sebesar 53,1%. Analisis jarak genetik memperlihatkan tingkat homogenitas intraspesifik yang sangat tinggi antar spesimen E. histrio dengan nilai 0,0000. Topologi pohon filogenetik secara tegas mengonfirmasi E. histrio sebagai kelompok monofiletik dengan dukungan posterior probability sebesar 0,97 yang membentuk subklad tersendiri di dalam genus Eos. Analisis estimasi waktu divergensi menunjukkan subklad E. histrio memisah pada masa Pleistosen Akhir atau sekitar 0,13 juta tahun yang lalu. Rekonstruksi sejarah demografi mendokumentasikan populasi yang sempat mengalami fase konstan dan mengalami resesi secara gradual sejak 110.000 tahun lalu, namun memperlihatkan tren penurunan drastis yang mengindikasikan fenomena bottleneck genetik pada masa kontemporer akibat desakan antropogenik. Nuri talaud memiliki variasi genetik intraspesifik yang rendah dan merupakan garis keturunan evolusi independen yang sangat rentan, sehingga memerlukan prioritas manajemen pelestarian dengan mengutamakan perlindungan habitat alami.

Red and Blue Lory (Eos histrio) is an endangered endemic species whose population is rapidly declining due to poaching and illegal wildlife trade. This study aimed to analyze the phylogenetic structure and genetic variation level of Red and Blue Lory compared to other species within the genus Eos based on the mitochondrial ND2 marker. Specimens were extracted from blood, organ, and feather samples, followed by PCR amplification and sequencing processes. The data were analyzed using the Bayesian Inference (BI) approach for phylogenetic tree reconstruction and divergence time estimation, along with the Bayesian Skyline Plot (BSP) method to trace the demographic history of the population. The results indicated that the target sequences were dominated by an A+T nucleotide bias with an average value of 53.1%. The genetic distance analysis demonstrated a remarkably high level of intraspecific homogeneity among E. histrio specimens with a value of 0.0000. The phylogenetic tree topology firmly confirmed E. histrio as a monophyletic group with a posterior probability support of 0.97, forming its own exclusive subclade within the genus Eos. The divergence time estimation revealed that the E. histrio subclade diverged during the Late Pleistocene, approximately 0.13 million years ago. The demographic history reconstruction documented a population that experienced a constant phase followed by a gradual recession since 110,000 years ago, but recently displayed a drastic downward trend indicating a contemporary genetic bottleneck phenomenon caused by anthropogenic pressures. In conclusion, E. histrio possesses low intraspecific genetic variation and serves as a highly vulnerable, independent evolutionary lineage, demanding priority conservation management focused primarily on habitat protection.

Kata Kunci : Eos histrio, filogenetik, jarak genetik, ND2, sejarah demografi