Keragaman Genetik dan Pola Kekerabatan pada Krisan (Chrysanthemum sp.) dan Zinnia (Zinnia elegans Jacq.) Menggunakan Marka SRAP

Nadira Ramdhani Lumintang, Prof. Dr. Ir. Aziz Purwantoro, M.Sc.; Widhi Dyah Sawitri, S.Si., M.Agr., Ph.D.

2026 | Tesis | S2 Ilmu Pemuliaan Tanaman

Krisan (Chrysanthemum sp.) dan zinnia (Zinnia elegans Jacq.) merupakan komoditas tanaman hias famili Asteraceae yang telah umum ditanam di Indonesia. Kedua spesies ini memiliki banyak variasi terutama pada bagian bunganya seperti tipe bunga maupun warna. Dalam melakukan pemuliaan tanaman hias, diperlukan informasi keragaman genetik dan pola kekerabatan guna menentukan tetua-tetua dengan latar belakang genetik luas yang diharapkan dapat menghasilkan variasi baru. Penelitian ini melakukan analisis keragaman genetik dan pola kekerabatan pada 11 kultivar krisan berdasarkan tipe bunga (tunggal dan spray) dengan 3 ulangan setiap kultivar dan 18 aksesi zinnia berdasarkan warna bunga (putih, kuning, oranye, merah, ungu, dan merah-ungu). Penelitian ini dilakukan dengan metode analisis molekuler berbasis marka SRAP dengan sepuluh kombinasi primer yang terdiri atas S1 (Me1-Em4), S2 (Me2-Em3), S3 (Me3-Em2), S4 (Me4-Em3), S5 (Me4-Em5), S6 (Me5-Em2), S7 (Me5-Em5), S8 (Me5-Em10), S9 (Me8-Em9), dan S10 (Me9-Em8). Sepuluh kombinasi primer SRAP berhasil mengamplifikasi 423 lokus polimorfik dari 424 total lokus dengan rerata nilai polymorphism information content (PIC) 0.25 (rentang 0.23-0.26). Analisis keragaman juga menghasilkan nilai pada masing-masing kelompok krisan (rerata uHe senilai 0.103 dan indeks Shannon senilai 0.158) dan zinnia (rerata uHe senilai 0.095 dan indeks Shannon senilai 0.116). Hasil analisis molekuler tersebut memerlihatkan keragaman genetik rendah pada kelompok krisan dan zinnia dimana variasi pada krisan merata baik dalam maupun antarpopulasi dan variasi pada zinnia didominasi dalam populasi berdasarkan AMOVA. Sementara itu, analisis pola kekerabatan menunjukkan bahwa kelompok krisan baik tipe tunggal dan spray saling terpisah, sedangkan kelompok zinnia masih saling menyebar dan bercampur berdasarkan dendogram UPGMA. Hasil penelitian ini mengindikasikan kesepuluh kombinasi primer SRAP cukup informatif dalam mengungkapkan variasi/polimorfisme genetik pada kelompok krisan maupun zinnia.  

Chrysanthemum (Chrysanthemum sp.) and zinnia (Zinnia elegans Jacq.) are ornamental plants from the Asteraceae family, commonly cultivated in Indonesia. These two species show wide variation in flower traits, including inflorescence and color. Understanding genetic diversity and relatedness patterns is essential for identifying parents with broad genetic backgrounds in ornamental plant breeding, which is expected to generate new variation. This study aimed to analyze the genetic diversity and relatedness of 11 chrysanthemum cultivars based on inflorescence (disbud and spray), with three replications for each cultivar, and 18 zinnia accessions based on flower color (white, yellow, orange, red, purple, and red-purple). The research utilized SRAP marker molecular analysis with ten primer combinations: S1 (Me1-Em4), S2 (Me2-Em3), S3 (Me3-Em2), S4 (Me4-Em3), S5 (Me4-Em5), S6 (Me5-Em2), S7 (Me5-Em5), S8 (Me5-Em10), S9 (Me8-Em9), and S10 (Me9-Em8). These primer combinations successfully amplified 423 polymorphic loci out of 424 total loci, with an average PIC of 0.25 (range 0.23-0.26). Diversity analysis produced values for each group or species, with the chrysanthemum group showing an average uHe of 0.103 and a Shannon Index of 0.116, and the zinnia group showing an average uHe of 0.095 and a Shannon Index of 0.116. The results indicated low genetic diversity in both chrysanthemum and zinnia, with variation in chrysanthemum evenly distributed within and among populations, whereas variation in zinnia was mainly within populations, as indicated by AMOVA. Additionally, the relatedness pattern analysis revealed that disbud types of chrysanthemum were separated from spray types. Furthermore, the zinnia populations were spread and mixed based on the UPGMA dendrogram. These findings suggest that the ten SRAP primer combinations are sufficiently informative for revealing genetic variation and polymorphism within both chrysanthemum and zinnia groups. 

Kata Kunci : tanaman hias, marka molekuler, keragaman genetik, pola kekerabatan