Aktivitas Antikanker dan Identifikasi Target Senyawa Turunan Kalkon Pada Sel MDA-MB-231: Kajian In Vitro dan In Silico

Bilqis Zahra Nabila, TNBC, chalcone, cytotoxicity, network pharmacology, molecular docking

2026 | Tesis | S2 Ilmu Kedokteran Dasar dan Biomedis

Triple Negative Breast Cancer (TNBC) merupakan salah satu subtipe

kanker payudara dengan prognosis paling buruk, yang ditandai dengan absennya

ekspresi reseptor tertentu. Senyawa kalkon berbasis klorotiofena merupakan

senyawa potensial yang terbukti memiliki aktivitas antikanker. Namun potensi

aktivitasnya terhadap TNBC belum pernah diketahui. Penelitian ini melakukan

evaluasi aktivitas antikanker dan identifikasi target potensial senyawa tersebut pada

TNBC melalui kajian sitotoksitas, uji selektivitas, network pharmacology, analisis

SwissADME dan molecular docking. Hasil skrining menunjukkan terdapat tiga

senyawa dengan aktivitas sitotoksisitas yang baik meliputi senyawa K4 (32,78

µg/mL), K5 (65,88 µg/mL) dan K6 (12,78 µg/mL) dengan indeks selektivitas < 2>

yang menandakan senyawa toksik terhadap sel normal. Target utama yang

ditemukan untuk senyawa tersebut meliputi NFKB1, JUN, mTOR, EGFR, dan

PARP1 yang mendasari aktivitas antikanker melalui mekanisme anti-proliferatif

dan synthetic lethality. Penghambatan proliferasi juga dikonfirmasi melalui jalur

PI3K/Akt yang diperkaya oleh target-target yang ditemukan tersebut. Ketiga

senyawa menunjukkan kesesuaian parameter farmakokinetik awal berdasarkan

evaluasi Lipinski’s pada SwissADME. Hasil molecular docking juga menunjukkan

prediksi pengikatan yang baik dengan kecenderungan energi minimal untuk target-

target dan senyawa dapat berikatan. Hasil studi ini berhasil mengungkap aktivitas

antikanker senyawa turunan kalkon terhadap sel TNBC, khususnya senyawa K4,

K5 dan K6 melalui mekanisme utama sebagai agen anti-proliferatif. Namun

senyawa tidak menunjukkan selektivitas yang baik terhadap sel normal.

Triple Negative Breast Cancer (TNBC) is a subtype of breast cancer with

the poorest prognosis, characterized by the absence of specific receptor expression.

Chlorothiophene-based chalcone derivatives are promising anticancer agents;

however, their effects against TNBC have not yet been elucidated. This study

evaluated the anticancer activity and identified potential targets of these compounds

in TNBC using cytotoxicity assays, selectivity tests, network pharmacology,

SwissADME analysis, and molecular docking. Cytotoxicity screening revealed

three compounds with notable activity: K4 (32.78 µg/mL), K5 (65.88 µg/mL), and

K6 (12.78 µg/mL), all with selectivity indices <2>

normal cells. The main predicted targets, NFKB1, JUN, mTOR, EGFR, and

PARP1, underline the compounds’ anticancer effects through anti-proliferative and

synthetic lethality mechanisms. Proliferation inhibition was further confirmed

through the PI3K/Akt signaling pathway, which was enriched among the identified

targets. These three compounds showed agreement with the initial pharmacokinetic

parameters based on Lipinski’s evaluation using SwissADME. Molecular docking

analysis also demonstrated favorable binding predictions, as indicated by low

binding energies between the compounds and their respective targets. Overall, this

study revealed the anticancer potential of chlorothiophene-based chalcone

derivatives against TNBC cells, particularly K4, K5, and K6, which primarily exert

anti-proliferative effects. However, the compound shows poor selectivity against

normal cells.

Kata Kunci : TNBC, kalkon, sitotoksisitas, network pharmacology, molecular docking /