Descriptive Sudy: LOXL1 Gene Mutation Profile of rs1048661 in Primary Open Angle Glaucoma Patients

Kaizan Athari Setiadi, dr. Krisna Dwi Purnomo Jati, Sp.M

2026 | Skripsi | PENDIDIKAN DOKTER

Glaukoma Sudut Terbuka Primer (Primary Open-Angle Glaucoma/POAG) adalah neuropati optik kronis yang secara signifikan dipengaruhi oleh faktor genetik, termasuk mutasi pada gen lysyl oxidase-like 1 (LOXL1). Secara khusus, varian single nucleotide polymorphism (SNP) rs1048661 telah dikaitkan dengan risiko glaukoma melalui gangguan homeostasis matriks ekstraseluler pada jalinan trabekula (trabecular meshwork). Penelitian ini bertujuan untuk mendeskripsikan profil mutasi gen SNP rs1048661 LOXL1 pada pasien POAG dan individu sehat dalam populasi Indonesia. Studi deskriptif observasional ini dilakukan di RSUP Dr. Sardjito dengan kohort 10 subjek, yang terdiri dari 5 pasien POAG dan 5 kontrol non-POAG. Analisis genetik dilakukan menggunakan targeted next-generation sequencing (NGS) pada platform Oxford Nanopore MinION. Median usia peserta adalah 65 tahun, dan 70?ri kohort adalah perempuan. Tidak ada perbedaan yang bermakna secara statistik antara kelompok POAG dan kontrol terkait usia (p = 0,46), tekanan darah sistolik (p = 0,25), tekanan darah diastolik (p = 0,60), maupun IMT (p = 0,06). Sequencing yang ditargetkan mengungkapkan bahwa varian rs1048661 ditemukan pada 80% (4 dari 5) kelompok POAG dibandingkan dengan 20% (1 dari 5) kelompok kontrol. Semua mutasi yang terdeteksi diidentifikasi sebagai varian missense G>T yang terletak pada posisi Chr15:73927205. Tingginya frekuensi varian rs1048661 di antara pasien POAG dibandingkan dengan kontrol menunjukkan adanya potensi hubungan antara penanda genetik ini dan kerentanan terhadap POAG pada populasi Indonesia. Meskipun bersifat eksploratif, hasil awal ini menyoroti potensi peran perubahan LOXL1 dalam patogenesis penyakit dan menekankan perlunya studi yang lebih besar untuk memvalidasi kegunaannya sebagai biomarker klinis untuk deteksi dini dan profil risiko genetik.

Primary Open-Angle Glaucoma (POAG) is a chronic optic neuropathy significantly influenced by genetic factors, including mutations in the lysyl oxidase-like 1 (LOXL1) gene. Specifically, the single nucleotide polymorphism (SNP) variant rs1048661 has been linked to glaucoma risk through the impairment of extracellular matrix homeostasis in the trabecular meshwork. This study aimed to describe the gene mutation profile of the LOXL1 rs1048661 SNP in patients with POAG and healthy individuals within an Indonesian population. This observational descriptive study was conducted at RSUP Dr. Sardjito with a cohort of 10 subjects, comprising 5 POAG patients and 5 non-POAG controls. Genetic analysis was performed using targeted next-generation sequencing (NGS) on the Oxford Nanopore MinION platform. The median age of participants was 65 years, and 70% of the cohort was female. No statistically significant differences were observed between the POAG and control groups regarding age (p = 0.46), systolic blood pressure (p = 0.25), diastolic blood pressure (p = 0.60), or BMI (p = 0.06). Targeted sequencing revealed that the rs1048661 variant was present in 80% (4 out of 5) of the POAG group compared to 20% (1 out of 5) of the control group. All detected mutations were identified as G>T missense variants located at position Chr15:73927205. The high frequency of the rs1048661 variant among POAG patients compared to controls suggests a potential association between this genetic marker and susceptibility to POAG in the Indonesian population. Although exploratory, these preliminary results highlight the potential role of LOXL1 alterations in disease pathogenesis and underscore the need for larger studies to validate its utility as a clinical biomarker for early detection and genetic risk profiling.

Kata Kunci : Primary Open-Angle Glaucoma, LOXL1, rs1048661, Next-Generation Sequencing, Indonesian population