EKSPLORASI TANAMAN KULIM (Scorodocarpus borneensis Becc.) SEBAGAI ANTIBAKTERI DAN ANTIBIOFILM POLIMIKROBA

Rafika Sari, Dr. Sylvia Utami Tunjung Pratiwi, M.Si; Dr.rer.nat. apt. Yosi Bayu Murti, M.Si; Dr. Ema Damayanti, M.Biotech

2026 | Disertasi | S3 Ilmu Farmasi

INTISARI

Biofilm merupakan penyebab utama 65–85% kasus infeksi kronis di dunia, serta memperburuk kondisi klinis. Senyawa bioaktif yang berasal dari bahan alam memiliki potensi sebagai sumber agen antimikroba alami. Salah satu tumbuhan yang berpotensi, serta belum pernah diteliti adalah Kulim (Scorodocarpus borneensis Becc.). Kulim (Scorodocarpus borneensis Becc.), tanaman endemik Kalimantan, secara tradisional digunakan sebagai rempah dan obat sakit perut. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan mengisolasi senyawa aktif dari kulit batang Kulim sebagai kandidat agen antibakteri dan antibiofilm terhadap bakteri monospesies maupun polimikroba (Staphylococcus aureus, Escherichia coli, dan Pseudomonas aeruginosa). Hidrosol, ekstrak, fraksi, dan isolat diuji menggunakan metode mikrodilusi untuk menentukan aktivitas antibakteri (MIC50), penghambatan pembentukan biofilm (MBIC50), dan degradasi biofilm (MBEC50) pada 24 dan 48 jam. Struktur biofilm polimikroba diamati dengan SEM, sementara identifikasi senyawa aktif menggunakan KLT, LC-HRMS, LC-MS/MS-TOF, serta spektroskopi 1D (¹H NMR, 13C-NMR) dan 2D NMR (COSY, DEPT-135, HSQC, dan HMBC). Uji toksisitas dilakukan terhadap embrio ikan Wader Pari (Rasbora lateristriata). Hasil menunjukkan bahwa ekstrak daun dan kulit batang memiliki aktivitas paling menonjol terhadap degradasi biofilm fase pematangan dengan nilai MBEC50 masing-masing 50,21 ?g/mL (S. aureus) dan 26,51 ?g/mL (E. coli). Fraksi kulit batang dan isolat menunjukkan aktivitas paling menonjol masing-masing terhadap E. coli yaitu degradasi biofilm MBEC50 7,31 ?g/mL dan penghambatan pembentukan biofilm MBIC50 10,82 ?g/mL. Kajian keamanan menunjukkan ekstrak kulit batang bersifat toksik LC50 (0,143 mg/mL), namun senyawa aktif berada dalam kategori aman berdasarkan kajian druglikeness ADMETLab 3.0, ProTox 3.0, dan ADMETSAR 3.0. Isolat kulit batang Kulim memiliki proposed structured yakni campuran stigmasterol dan ?-sitosterol (1:1) serta menunjukkan potensi kuat sebagai agen antibiofilm. Hasil penelitian ini mendukung pemanfaatan tanaman Kulim sebagai sumber alami untuk pengembangan kandidat antibiofilm pada infeksi polimikroba.

Kata kunci: antibiofilm, druglikeness, Rasbora lateristriata, Scorodocarpus borneensis Becc.

ABSTRACT

Biofilms are the primary cause of 65–85% of chronic infection cases worldwide and significantly exacerbate clinical outcomes. Bioactive compounds derived from natural products hold great potential as sources of natural antimicrobial agents. One such promising plant, which remains largely unexplored, is Kulim (Scorodocarpus borneensis Becc.). Scorodocarpus borneensis Becc. (Kulim), an endemic Borneo plant, has traditionally been used as a spice and a remedy for gastrointestinal disorders. The objective of this study was to identify and isolate bioactive compounds from Kulim bark with potential antibacterial and antibiofilm activity against mono- and polymicrobial cultures of Staphylococcus aureus, Escherichia coli, and Pseudomonas aeruginosa. We evaluated the antibacterial activity (MIC50), biofilm inhibition (MBIC50), and biofilm degradation (MBEC50) of hydrosols, extracts, fractions, and isolates using the microdilution method at 24 and 48 hours. We examined polymicrobial biofilm structures using SEM and identified active compounds through TLC, LC-HRMS, LC-MS/MS-TOF, and spectroscopic analyses, including 1D (¹H and ¹³C-NMR) and 2D NMR (COSY, DEPT-135, HSQC, and HMBC). Toxicity was assessed using Rasbora lateristriata embryos. The results indicated that the leaf and bark extracts exhibited the strongest activity against mature biofilm degradation, with MBEC50 values of 50,21 ?g/mL (S. aureus) and 26,51 ?g/mL (E. coli), respectively. Bark fractions and isolates demonstrated notable activity against E. coli with MBEC50 and MBIC50 values of 7,31 and 10,82 ?g/mL, respectively. The safety evaluation revealed that the bark extracts were toxic (LC50 = 0,143 mg/mL), while the isolated bioactive compound was classified as safe based on drug-likeness and ADMET predictions (ADMETLab 3.0, Pro-Tox-3.0, and ADMETSAR 3.0). The proposed structure, resembling a mixture of stigmasterol and ?-sitosterol (1:1), displayed strong antibiofilm potential. These results suggest that Kulim bark is a promising natural source for developing antibiofilm agents that target polymicrobial infections.

Keywords: antibiofilm, druglikeness, polymicrobial, Rasbora lateristriata, Scorodocarpus borneensis Becc.

Kata Kunci : Kata kunci: antibiofilm, druglikeness, Rasbora lateristriata, Scorodocarpus borneensis Becc.