Potensi Circular RNA Sebagai Biomarka Diagnostik Noninvasif Untuk Hipertensi Arteri Pulmonal Pada Pasien Defek Septum Atrium Dewasa: Studi Eksploratif

Fajri Marindra Siregar, Prof. dr. Sofia Mubarika Haryana, M.Med.Sc, Ph.D; dr. Anggoro Budi Hartopo, M.Sc., Ph.D., SpPD., SpJP

2025 | Disertasi | S3 Kedokteran Umum

Latar belakang : Hipertensi arteri pulmonal (HAP) merupakan penyakit progresif dengan prognosis yang buruk dan tingkat mortalitas tinggi, serta membutuhkan pemeriksaan invasif untuk penegakkan diagnosisnya. Circular RNA (circRNA), sebagai molekul non koding dengan struktur melingkar yang stabil dan spesifik terhadap jaringan, memiliki potensi sebagai biomarker noninvasif melalui pendekatan liquid biopsy.

Tujuan: Mengidentifikasi potensi circRNA sebagai biomarka diagnostik noninvasif untuk hipertensi arteri pulmonal pada pasien defek septum atrium dewasa (HAP-DSA) yang belum dikoreksi di RSUP Dr. Sardjito Yogyakarta.

Metode: Penelitian dilakukan menggunakan pendekatan profiling dengan mikroarray, validasi ekspresi menggunakan qRT-PCR, dan identifikasi fungsi biologis kandidat circRNA secara bioinformatik.

Hasil: Profil ekspresi circRNA menunjukkan perbedaan yang bermakna antara kelompok HAP-DSA dan kontrol (DSA-non HP), dengan 26 circRNA mengalami upregulasi dan 30 circRNA mengalami downregulasi. Salah satu circRNA, hsa_circ_0086475 (mengalami downregulasi), diidentifikasi sebagai kandidat biomarker utama berdasarkan analisis ekspresi dan relevansi biologisnya. Ekspresi hsa_circ_0086475 menunjukkan hubungan yang signifikan terhadap mPAP dan PVRI pada subjek perempuan, namun tidak ditemukan hubungan serupa pada subjek laki-laki. Analisis bioinformatik lebih lanjut menunjukkan keterlibatan hsa_circ_0086475 dalam meregulasi gen-gen kunci yang berperan dalam patogenesis HAP, seperti BMPR2, ATP13A3, CAV1, dan GDF2.

Simpulan: Berdasarkan ekspresi dan fungsi biologisnya hsa_circ_0086475 memiliki potensi sebagai biomarker diagnostik noninvasif terhadap HAP-DSA.

Background: Pulmonary arterial hypertension (PAH) is a progressive disease with poor prognosis and high mortality, often requiring invasive procedures for diagnosis. Circular RNAs (circRNAs), non-coding RNAs with a stable circular structure and high tissue specificity, have emerged as promising noninvasive biomarkers through liquid biopsy approaches.

Objective: To identify the potency of circRNAs as noninvasive diagnostic biomarkers for PAH in adult patients with uncorrected atrial septal defect (PAH-ASD) at Dr. Sardjito General Hospital, Yogyakarta.

Methods: This study employed microarray-based circRNA profiling, expression validation through qRT-PCR, and identification of circRNA biological function based on bioinformatic analysis.

Results: The circRNA expression profile showed significant differences between the PAH-ASD and control (ASD-non-PH) groups, with 26 circRNAs upregulated and 30 circRNAs downregulated. One circRNA, hsa_circ_0086475 (downregulated), was identified as a key biomarker candidate based on expression analysis and its biological relevance. The expression of hsa_circ_0086475 showed a significant association with mPAP and PVRI in female subjects, but no similar association was found in male subjects. Further bioinformatic analysis showed the involvement of hsa_circ_0086475 in regulating key genes involved in the pathogenesis of HAP, such as BMPR2, ATP13A3, CAV1, and GDF2.

Conclusion: Based on their expression profiles and biological functions, hsa_circ_0086475 demonstrate potency as noninvasive diagnostic biomarkers for PAH-ASD.

Kata Kunci : Biomarker, circular RNA, congenital heart disease, pulmonary arterial hypertension