Status Taksonomi Cyrtodactylus (Reptilia: Gekkonidae) di Nusa Tenggara Barat berdasarkan Karakter Morfologis dan Molekuler

Sandra Rafika Devi, Dr. Rury Eprilurahman, S.Si., M.Sc.

2025 | Tesis | S2 Biologi

Cyrtodactylus pertama kali dideskripsikan oleh Gray pada tahun 1827 dan banyak tersebar di Asia, Australia Utara dan Kepulauan Pasifik termasuk Wallacea. Nusa Tengara Barat adalah salah satu wilayah di Wallacea yang mempunyai endemisitas fauna yang tinggi namun keanekaragaman hayatinya masih belum banyak dipelajari. Sejarah geografi terbentuknya Nusa Tenggara Barat cukup komplek, pulau-pulaunya terbentuk dari ocean island yang muncul dari dasar laut dan secara terpisah bukan bagian dari landasan kontinen. Peristiwa tersebut dapat mempengaruhi persebaran Cyrtodactylus di Nusa Tenggara Barat. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui status taksonomi Cyrtodactylus di Nusa Tenggara Barat berdasarkan karakter morfologis dan molekuler. Karakter morfologis yang diamati meliputi karakter morfometri dan karakter meristik. Analisis data morfologis menggunakan Principal Component Analysis dan Discriminant Function Analysis pada aplikasi RStudio. Identifikasi karakter molekuler dengan mengisolasi gen ND2 pada jaringan liver untuk diamplifikasi dengan metode Polymerase Chain Reaction dengan Primer M112F dan M1123R.  Amplifikasi gen ND2 diskuensing, selanjutnya skuens dianalisis dengan  menggunakan aplikasi GeneStudio, MEGA12, Kakuasan4, Mr.Bayes dan FigTree. Analisis data molekuler dilakukan untuk memperoleh jarak genetik dan rekontruksi pohon filogenetik dari Cyrtodactylus. Berdasarkan topologi pohon filogenetik dan jarak genetik menjukkan adanya temuan distribusi baru C. jatnai dari Pulau Lombok, serta memiliki kesamaan karakter morfologi (precloacal dan femoral pore pada jantan) dengan spesimen tipe dari Pulau Bali. Selain itu juga terdapat pemisahan cryptic species antara klade C. darmandvillei komplek dari Sumbawa Barat dan Sumbawa Timur. Penelitian ini dapat mengevaluasi dan menambah catatan taksonomi terbaru dari distribusi species Cyrtodactylus di Nusa Tenggara Barat.

Cyrtodactylus was first described by Gray in 1827 and is widely distributed in Asia, Northern Australia and the Pacific Islands including Wallacea. West Nusa Tenggara is one of the regions in Wallacea that has high fauna endemicity but its biodiversity is still not widely studied. The geographical history of the formation of West Nusa Tenggara is quite complex, the islands were formed from ocean islands that emerged from the seabed and were not part of the continental shelf. This process can affect the distribution of Cyrtodactylus in West Nusa Tenggara. This study aims to determine the taxonomic status of Cyrtodactylus in West Nusa Tenggara based on morphological and molecular characters. The morphological characters observed include morphometric characters and meristic characters. Analysis of morphological data used Principal Component Analysis and Discriminant Function Analysis in the RStudio application. Identification of molecular characters by isolating the ND2 gene in liver tissue to be amplified by the Polymerase Chain Reaction method with Primers M112F and M1123R. ND2 gene was amplified and sequenced using GeneStudio, MEGA12, Kakuasan4, Mr.Bayes, and FigTree. Molecular data analysis was performed to obtain genetic distances and reconstruct the phylogenetic tree of Cyrtodactylus. Based on the topology of the phylogenetic tree and genetic distance, it shows the discovery of a new distribution of C. jatnai from Lombok Island, and has similar morphological characters (precloacal and femoral pores in males) with the type specimen from Bali Island. In addition, there is separation of cryptic  species between the C. darmandvillei complex clade from West Sumbawa and East Sumbawa. This study can evaluate and add to the latest taxonomic records of the distribution of Cyrtodactylus species in West Nusa Tenggara.

Kata Kunci : Cyrtodactylus, morphological, molecular, identification, phylogenetic