Isolasi, Uji Aktivitas Antibakteri, dan Identifikasi Kapang Endofit Daun Cengkeh (Syzygium aromaticum L.) Terhadap Isolat Klinik Escherichia coli MDR

Fairuz Fajriani Kusumaningrum, Wahyu Aristyaning Putri, S.Si., M.Sc., Ph.D.

2025 | Skripsi | BIOLOGI

E. coli MDR merupakan agen infeksi yang paling sering ditemukan sebagai penyebab infeksi saluran kemih. Bakteri ini bersifat patogen atau mudah menular. E. coli MDR dapat menginfeksi individu sehat dengan persentase sebesar 80 95%. Meskipun antibiotik konvensional masih menjadi terapi utama untuk mengobati ISK, penggunaan yang tidak tepat atau berlebihan dapat menyebabkan resistensi antimikroba. Salah satu tantangan besar dalam penanganan ISK saat ini adalah munculnya bakteri multidrug-resistant (MDR), yaitu bakteri yang resisten terhadap berbagai jenis antibiotik. Oleh karena itu, pencarian sumber antibiotik alternatif yang bersifat alami menjadi sangat penting. Salah satu sumber potensial penghasil antibiotik alami adalah kapang endofit yang hidup pada daun tanaman cengkeh. Berdasarkan hal tersebut, penelitian ini bertujuan untuk mengkaji potensi penghambatan antibakteri atau antibiotik pada kapang endofit daun cengkeh, serta spesies kapang endofitnya yang berpotensi menjadi alternatif obat baru untuk menangani bakteri MDR di Indonesia. Metode yang dilakukan adalah kapang endofit dari daun cengkeh ditumbuhkan pada medium PDA, lalu dilakukan uji antibakteri, setelah itu dilakukan identifikasi molekuler yang menggunakan metode short amplicon sequencing. Hasil penelitian menunjukkan terdapat dua isolat kapang endofit hasil isolasi dari daun tanaman cengkeh. KD1 memiliki karakter warna permukaan atas berwarna putih keabu-abuan dan warna permukaan bawah berwarna kuning, memiliki tekstur velvety, bentuk circular, margin entire, serta laju pertumbuhan cepat, lalu KD2 memiliki karakter warna permukaan atas berwarna hijau kehitaman dan permukaan bawah berwarna hitam, memiliki tekstur woolly, bentuk irregular, margin undulate, serta laju pertumbuhan cukup cepat. KD1 dan KD2 pada uji antibakteri memiliki kemampuan penghambatan kuat untuk E. coli ATCC 25922, namun hanya KD2 yang berpotensi untuk antiMDR. Uji identifikasi molekuler menunjukkan KD1 adalah Colletotrichum gloeosporioides dan KD2 adalah Phyllosticta capitalensis.

E. coli MDR is the most frequently found infectious agent causing urinary tract infections. This bacterium is pathogenic or easily transmissible. MDR E. coli can infect healthy individuals with a percentage of 80-95%. Although conventional antibiotics are still the main therapy for treating UTIs, improper or excessive use can lead to antimicrobial resistance. One of the major challenges in the current management of UTIs is the emergence of multidrug-resistant (MDR) bacteria, which are resistant to various types of antibiotics. Therefore, the search for alternative natural antibiotic sources becomes very important. One potential source of natural antibiotic producers is the endophytic mold living on clove tree leaves. Based on this, this research aims to examine the antibacterial or antibiotic inhibition potential of the endophytic mold from clove leaves, as well as their species that have the potential to become new drug alternatives for addressing MDR bacteria in Indonesia. The method used involved growing endophytic fungi from clove leaves on PDA medium, followed by antibacterial testing, and then molecular identification using the short amplicon sequencing method. The research results show that there are two isolates of endophytic fungi isolated from clove plant leaves. KD1 has the character of an upper surface color that is grayish-white and a lower surface color that is yellow, with a velvety texture, circular shape, entire margin, and rapid growth rate. KD2 has the character of an upper surface color that is dark greenish-black and a lower surface color that is black, with a woolly texture, irregular shape, undulate margin, and fairly rapid growth rate. KD1 and KD2 in the antibacterial test showed strong inhibition against E. coli ATCC 25922, but only KD2 has the potential for anti-MDR. Molecular identification tests indicate that KD1 is Colletotrichum gloeosporioides and KD2 is Phyllosticta capitalensis.

Kata Kunci : Antibakteri, Eschericia coli MDR, Daun Cengkeh, Kapang Endofit.