Analisis Ekstrak Cengkeh (Syzygium aromaticum L.) terhadap Sitotoksik Sel Kanker Payudara MCF 7

Siti Hajar Permatahati Shofyani, Wahyu Aristyaning Putri, S.Si., M.Sc., Ph.D

2025 | Skripsi | BIOLOGI

Kanker payudara merupakan tantangan kesehatan global yang mendesak, dalam pentingnya pengembangan agen terapeutik inovatif. Ekstrak cengkeh (Syzygium aromaticum L.), yang kaya akan senyawa bioaktif seperti eugenol, berpotensi sebagai kandidat antikanker. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan mengidentifikasi senyawanya, memprediksi interaksi molekuler terhadap protein target ESR1 pada sel kanker payudara MCF 7, serta menguji aktivitas sitotoksiknya secara in vitro. Metode penelitian meliputi ekstraksi cengkeh dengan soxhlet (n-heksana, EC-N) dan maserasi (etanol, EC-E), diikuti identifikasi senyawa menggunakan Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS). Prediksi interaksi molekuler dilakukan secara in silico dengan molecular docking menggunakan PyRx, UCSF Chimera, DS Visualizer, dan PyMOL, sementara uji sitotoksisitas in vitro terhadap sel MCF 7 dilaksanakan menggunakan metode MTT Assay pada rentang konsentrasi 15,625 hingga 2000 ppm. Hasil penelitian menunjukkan bahwa GC-MS mengidentifikasi 88 senyawa kimia dalam ekstrak cengkeh, dengan eugenol sebagai komponen dominan pada EC-N (53,6%) dan EC-E (35,4%), serta interaksi molekuler stabil antara senyawa bioaktif dengan protein target ESR1 in silico. Uji sitotoksisitas in vitro mengindikasikan aktivitas penghambatan pertumbuhan sel MCF 7, dengan nilai IC₅₀ sebesar 871,75 ppm untuk EC-N dan 1623 ppm untuk EC-E. Oleh karena itu, ekstrak cengkeh mengandung senyawa bioaktif yang mampu berinteraksi secara molekuler dan menunjukkan aktivitas tidak toksik terhadap sel kanker payudara MCF 7. 

Breast cancer poses a pressing global health challenge, highlighting the urgent need for developing innovative therapeutic agents. Clove extract (Syzygium aromaticum L.), rich in bioactive compounds such as eugenol, shows potential as an anticancer candidate. Therefore, this study aimed to identify its compounds, predict molecular interactions with the ESR1 target protein in MCF 7 breast cancer cells, and test its cytotoxic activity in vitro. The research methods included clove extraction using soxhlet (n-hexane, EC-N) and maceration (ethanol, EC-E), followed by compound identification using Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS). Molecular interaction prediction was performed in silico via molecular docking using PyRx, UCSF Chimera, DS Visualizer, and PyMOL, while the in vitro cytotoxicity test against MCF 7 cells was conducted using the MTT Assay at concentrations ranging from 15.625 to 2000 ppm. The results showed that GC-MS identified 88 chemical compounds in clove extract, with eugenol as the dominant component in EC-N (53.6%) and EC-E (35.4%), and demonstrated stable molecular interactions between bioactive compounds and the ESR1 target protein in silico. The in vitro cytotoxicity test indicated inhibitory activity against MCF 7 cell growth, with IC₅₀ values of 871.75 ppm for EC-N and 1623 ppm for EC-E. In conclusion, clove extract contains bioactive compounds capable of molecular interaction and exhibits cytotoxic activity against MCF 7 breast cancer cells, supporting its potential development as a natural anticancer agent.

Kata Kunci : ekstrak cengkeh, MCF 7, ESR1, sitotoksisitas, molecular docking