Evaluasi Resistensi Antibiotika Bakteri Escherichia coli Penyebab Infeksi Saluran kemih

Desi Ratna Nengsih, Dr. rer. nat. Abdul Rahman Siregar, M. Biotech. ; Prof. Budi Setiadi Daryono, M.Agr.Sc.

2025 | Tesis | S2 Biologi

Infeksi saluran kemih adalah kondisi ditemukannya mikroorganisme patogen pada saluran kemih yang sering kali disebabkan oleh Escherichia coli. Penggunaan antibiotik untuk penanganan infeksi ini menyebabkan resistensi E. coli sehingga sulit ditangani, disebut Multidrug Resistant (MDR). Tujuan penelitian untuk menganalisis gen-gen pada E. coli penyebab resistensi terhadap antibiotik. Metode yang digunakan dalam penelitian ini yaitu ekstraksi DNA dan Whole Genome Sequencing (WGS) untuk mendapatkan keseluruhan genom, serta analisis data genomik. Hasil Penelitian menunjukkan adanya gen resisten pada kromosom dan plasmid E. coli MDR. Gen-gen resisten pada kromosom yang terdeteksi meliputi mdf(A), aac(3)-IIa, blaOXA-1, aac(6')-Ib-cr, dan blaCTX-M-15. Gen resisten yang ditemukan pada plasmid yaitu tet(A), mph(A), sul1, aadA5, dan dfrA17. Penemuan ini dapat menjadi acuan untuk penemuan obatan atau terapi baru dalam penanganan infeksi saluran kemih.

Urinary tract infection was a condition where pathogenic microorganisms were found in the urinary tract, which was often caused by Escherichia coli. The use of antibiotics to treat this infection caused E. coli to become resistant, making it difficult to treat, a condition known as multidrug resistance (MDR). The aim of the research was to analyze the genes in E. coli that caused resistance to antibiotics. The methods used in this research were E. coli DNA extraction and whole genome sequencing to obtain the entire genome, as well as analysis of genomic data. The research results showed the presence of resistance genes on the chromosomes and plasmids of MDR E. coli. The resistance genes detected on the chromosome included mdf(A), aac(3)-lla, blaOXA-1, acc(6’)-Ib-cr, and blaCTX-M-15. The resistance genes found on the plasmid were tet(A), mph(A), sul1, aadA5, and dfrA17. This finding could serve as a reference for the development of new treatments or therapies in the management of urinary tract infections.

Kata Kunci : Infeksi Saluran Kemih, Escherichia coli, Multidrug Resistant, Antibiotik, Genomik