Hubungan Ekspresi NLRC5 dengan Gambaran Klinikopatologi, Tingkat Metilasi dan Ketahanan Hidup Pasien Kanker Payudara HR+HER2-

Raden Ajeng Dyah Laksmi Dewi, dr. Herjuna Hardiyanto Sp.B. Subsp. Onk. (K).; Prof. Dr. dr. Teguh Aryandono Sp.B. Subsp. Onk. (K)

2025 | Tesis-Subspesialis | SUBSPESIALIS ILMU BEDAH

Latar Belakang: MHC class I transactivator NLRC5 berperan penting dalam respon imun terhadap tumor melalui perannya dalam meningkatkan pemrosesan dan presentasi antigen tumor pada sel T sitotoksik. Pada studi ini dilakukan analisis terkait hubungan ekspresi NLRC5 dengan level metilasi, gambaran klinikopatologi dan ketahanan hidup pasien kanker payudara jenis HR+/HER2-. 

Metode: Penelitian ini menggunakan 3 cohort terdiri dari 39 pasien kanker payudara HR+/HER2- di RSUP Dr. Sardjito, 410 pasien pada cohort TCGA breast invasive carcinoma, dan 1785 pasien dari cohort Cancerome Analysis Network. Analisis ekspresi NLRC5 dilakukan dengan metode qRT-PCR dan RNA Seq. Metode pyrosequencing dan 450K array digunakan dalam analisis metilasi NLRC5. Analisis survival dilakukan dengan kurva Kaplan-Meier dan log rank test. 

Hasil: Ekspresi NLRC5 berkorelasi dengan ekspresi gen yang berhubungan dengan jalur presentasi antigen MHC class I. Tumor dengan ekspesi NLRC5 yang tinggi memiliki ekspresi penanda sel T CD8+ sitotoksik dan penanda aktivasi sel T, serta beberapa biomarker respon terhadap imunoterapi. Analisis promoter NLRC5 menununjukkan hipermetilasi pada cg07839457, dengan tingkat metilasi berkorelasi negatif dengan ekspresi NLRC5. Tingginya ekspresi NLRC5 berhubungan dengan OS yang lebih baik pada pasien kanker payudara HR+ HER2-, namun tidak berhubungan dengan DFS. 

Kesimpulan: Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa ekspresi NLRC5 yang tinggi berkorelasi dengan aktivasi respon imun terhadap tumor, dan kelangsungan hidup yang lebih baik pada kanker payudara HR+/HER2-. NLRC5 berpotensi sebagai biomarker aktivasi respon imun dan prognosis serta dapat dimodifikasi secara epigenetik untuk meningkatkan respon terapi pada pasien kanker payudara HR+/HER2-

Background: The MHC class I transactivator NLRC5 plays a role in the immune responses against tumors by enhancing the processing and presenting tumor antigens to cytotoxic T cells. In this study, we characterized the expression, regulation via DNA methylation, and clinicopathological significance of NLRC5 in the survival of HR+/HER2- breast cancer patients. 

Methods: This study employs 3 cohorts, consists of 39 HR+/HER2- primary breast cancers in Sardjito Hospital, 410 patients from cohort TCGA breast invasive carcinoma, and 1785 patients from cohort Cancerome Analysis Network Expression. Analysis of NLRC5 was done by qRT-PCR and RNA-Seq, and the DNA methylation analysis by pyrosequencing 450K methylation array. Survival analyses were done using Kaplan-Meier and log-rank test. 

Results: NLRC5 expression correlates with the expression of genes involved in MHC class I antigen presentation pathway. Breast tumors with high expression of NLRC5 show higher expression of T cell markers, markers of cytotoxic T cell activation and several biomarkers of responses to immunotherapy. NLRC5 promoter analysis shows hypermethylation at cg07839457, with methylation levels negatively correlates with NLRC5 expression. High NLRC5 expression is associated with higher overall survival in HR+ HER2- patients,however, no association was found in DFS. 

Conclusion: Higher expression of NLRC5 correlates with immune activation and better survival in HR+/HER2- breast cancer patients. The results of this study can support the possible role of NLRC5 as a biomarker for the prognosis of HR+/HER2- breast cancer that can be epigenetically modified to increase the effectiveness of immunotherapy in HR+/HER2- breast cancer. 

Kata Kunci : kanker payudara, NLRC5, MHC class I, metilasi DNA, imunologi tumor