Identifikasi Morfologi dan Molekuler Turbinaria ornata (Turner) J. Agardh 1848 di Pantai Nguyahan dan Ngrumput Kabupaten Gunungkidul Berdasarkan ITS-2 nrDNA

Varisa Agesta Alma Putri, Dr. Ratih Ida Adharini, S. Pi., M. Si.

2025 | Skripsi | MANAJ. SUMBER DAYA PERIKANAN

Turbinaria sp. merupakan rumput laut coklat (Phaeophyta) yang memiliki banyak manfaat dalam berbagai bidang industri seperti industri pangan dan non pangan. Pantai Nguyahan dan Ngrumput merupakan habitat Turbinaria sp. yang melimpah di Kabupaten Gunungkidul. Kondisi masyarakat sekitar masih belum memahami jenis-jenis Turbinaria sp. di Pantai Nguyahan dan Ngrumput sehingga dibutuhkan penelitian ini untuk mengidentifikasi jenis Turbinaria yang ada di pantai tersebut. Penelitian ini dilakukan dengan mengidentifikasi sampel Turbinaria sp. yang ada di Pantai Nguyahan dan Ngrumput menggunakan metode analisis morfologi dan molekuler berdasarkan gen ITS- 2 nrDNA. Sampel Turbinaria sp. dikoleksi dari Pantai Nguyahan dan Ngrumput dengan metode jelajah di beberapa sisi pantai. Sampel diambil secara acak di beberapa titik yang berbeda. Analisis yang dilakukan yaitu dengan melihat jarak genetik dan membuat pohon filogenetik menggunakan software MEGA11. Hasil yang didapatkan setelah dilakukannya identifikasi yaitu pada Pantai Nguyahan dan Ngrumput ditemukan spesies yang sama berupa Turbinaria ornata dengan percent identity 98,78?n query cover 100%. Turbinaria ornata yang ditemukan di Pantai Nguyahan dan Pantai Ngrumput memiliki hubungan kekerabatan dengan Turbinaria ornata dari perairan Australia dan perairan Cina dengan jarak genetik 0,01.

Turbinaria sp. is a species of brown macroalgae (Phaeophyta) with significant potential across various industrial sectors, including both food and non-food applicattions. The coastal areas of Nguyahan and Ngrumput serve as abundant natural habitats for Turbinaria sp. within Gunungkidul Regency. The lack of understanding among the local community regarding the species of Turbinaria sp. found at Nguyahan and Ngrumput Beaches necessitates this study to identify the specific Turbinaria species present in these areas. Therefore, this study aims to identity the Turbinaria spesies found along these coastal environments. Spesies identification was conducted through morphological and molecular analyses, utilizing the Internal Transcribed Spacer 2 (ITS-2) region of nuclear ribosomal DNA (nrDNA) genes. Turbinaria sp. samples were collected from Nguyahan and Ngrumput Beaches using an roaming method (road sampling), with specimens randomly sampled from multiple location along the coastline. Genetic analysis and phylogenetic tree construction were performed using MEGA11 software. The identification results revealed that a single spesies, Turbinaria ornata was present in both Nguyahan and Ngrumput Beaches, exhibiting a percent identity of 98,78% and query cover of 100%. The Turbinaria ornata specimens from Nguyahan and Ngrumput Beaches demonstrated a close phylogenetic relationship with Turbinaria ornata populations from Australian waters and Chinese waters, supported by a genetic distance value of 0,01.

Kata Kunci : ITS-2, Morfologi, Molekuler, Pantai Ngrumput, Pantai Nguyahan, Turbinaria ornata / ITS-2, Morphology, Molecular, Ngrumput Beach, Nguyahan Beach, Turbinaria ornata