Deteksi dan Analisis Sekuens Endosimbion Wolbachia Diaphorina citri (Hemiptera: Liviidae) pada Populasi Laboratorium dan Lapangan

VINDI SEPTIA PUTRI, Alan Soffan, S.P., M.Sc., Ph.D. ; Prof. Dr. Ir. Siti Subandiyah, M.Agr.Sc.

2024 | Skripsi | ILMU HAMA & PENYAKIT TUMBUHAN

Wolbachia dikenal karena perannya dalam berbagai aspek biologi serangga vektor. Dalam penelitian ini, kami menyelidiki deteksi dan analisis urutan nukleotida serta urutan amino acid Wolbachia pada Diaphorina citri, serangga vektor penyakit Huanglongbing pada tanaman jeruk. Metode deteksi molekuler menggunakan teknik PCR dan analisis urutan dilakukan pada populasi D. citri di laboratorium dan lapangan dari Yogyakarta, Bengkulu, Cianjur, Lampung, Kalimantan, dan Bogor. Hasilnya menunjukkan keberadaan Wolbachia yang konsisten pada populasi D. citri, dengan rekombinasi urutan nukleotida dan amino acid yang berbeda antar lokasi. Hasil lain juga di dapatkan bahwa nukleotida pada Wolbachia di dominasi oleh kandungan basa A+T. Temuan ini menggambarkan peran penting Wolbachia dalam interaksi antara D. citri dan patogen yang ditularkannya, dan menyoroti potensi aplikasi strategi berbasis manipulasi Wolbachia dalam pengendalian penyakit jeruk. Dengan demikian, penelitian ini memberikan wawasan baru yang relevan untuk pengembangan strategi pengendalian penyakit tanaman yang berkelanjutan.

Wolbachia are known for their roles in various aspects of insect vector biology. In this study, we investigated the detection and analysis of nucleotide sequences and amino acid sequences of Wolbachia in Diaphorina citri, the vector insect of Huanglongbing disease in citrus plants. Molecular detection methods using PCR techniques and sequence analysis were performed on laboratory and field populations of D. citri from Yogyakarta, Bengkulu, Cianjur, Lampung, Kalimantan, and Bogor. The results showed the consistent presence of Wolbachia in D. citri populations, with variations in nucleotide and amino acid sequences among different locations. Another finding was that the nucleotide sequences of Wolbachia were dominated by A+T base content. These findings illustrate the important role of Wolbachia in the interaction between D. citri and the pathogens it transmits, and highlight the potential application of Wolbachia manipulation-based strategies in citrus disease control. Thus, this research provides new insights relevant to the development of sustainable plant disease control strategies.

Kata Kunci : Kata kunci : Sekuens, Nukleotida, Wolbachia / Keyword : Sequence, Nucleotides, Wolbachia