Profil Ekspresi MiR-31-5p, MiR-4286, MiR-135b-5p, MiR-155-5p, MiR-1-3p, MiR-145-5p sebagai Kandidat Biomarker Metastasis Karsinoma Sel Skuamosa Penis ke Kelenjar Getah Bening pada Etnis Bali

DESAK PUTU OKI LESTARI, Prof.Dr.dr. Irianiwati, Sp.PA (K); Prof. dr. Sofia Mubarika, M.Med.Sc., Ph.D

2024 | Disertasi | S3 Kedokteran Umum

Latar Belakang: Metastasis ke kelenjar getah bening (KGB) mengindikasikan prognosis buruk pada penderita karsinoma sel skuamosa penis (KSSP). MiRNA berperan mengatur berbagai proses biologis penting, mengalami disregulasi pada berbagai jenis kanker, dan terlibat dalam metastasis. Hasil dari studi pendahuluan miRNA profiling didapatkan 6 miRNA yang paling kuat meliputi miR-31-5p, miR-135-5p, miR-155-5p, miR-4286, miR-1-3p, dan miR-145-5p. Akan tetapi belum diketahui seberapa besar ekspresi miR tersebut pada tumor primer (TP) dan tumor metastasis (TM) ke KGB KSSP, serta perannya pada karsinogenesis sehingga dilakukanlah penelitian ini. Tujuan: Untuk mengetahui perbedaan ekspresi miR-31-5p, miR-135-5p, miR-155-5p, miR-4286, miR-1-3p, dan miR-145-5p pada TP dan TM KGB dibandingkan dengan kontrol, serta enrichment analysis-nya pada karsinogenesis KSSP. Metode: Sample berjumlah 12 sampel (4 TP KSSP, 4 TM ke KGB, 4 kontrol). Hubungan ekspresi miR-31-5p, miR-135-5p, miR-155-5p, miR-4286, miR-1-3p, dan miR-145-5p antar kelompok dinilai dengan uji t-test dan nilai p ditetapkan <0>enrichment analysis in Silico. Hasil: Seluruh pasien KSSP ditemukan dengan stadium lanjut, angka kematian 75%. Novelty miRNA didapatkan 107 miRNA signifikan pada TP, 81 miRNA pada TM ke KGB. Up-regulated miR-31-5p, miR-135b-5p, miR-155-5p, miR-4286, ditemukan pada TP dan TM (p<0>. Down-regulated miR-1-3p dan miR-145-5p ditemukan pada TP dan TM dibandingkan dengan kontrol (p<0>Pathway dan functional analysis in Silico dari 100 validated targeted gene yang paling banyak ditarget oleh dysregulated miRNA, berperan kuat dalam proses biogenesis miRNA dan karsinogenesis (FDR<0>Kesimpulan: up-regulated (miR-31-5p, miR-135-5p, miR-155-5p, miR-4286), dan down-regulated (miR-1-3p, miR-145-5p) merupakan panel novelty miRNA yang signifikan ditemukan pada TP dan TM ke KGB pada KSSP yang berasal dari pasien etnis Bali. MiR-31-5p dan miR-1-3p merupakan kandidat biomarker terkuat untuk terjadinya metastasis KGB KSSP. Panel miRNA ini dapat dipakai sebagai kandidat untuk mendukung pengembangan biomarker diagnosis, personal target terapi, diagnosis dan prognosis kanker penis.

Background: Penile squamous cell carcinoma (PSCC) patients with lymph node (LN) metastasis have a poor prognosis. MiRNAs control many critical biological processes, experience dysregulation, and play a part in the development of many cancers. They also play a role in metastasis. In preliminary research, volcano plot analysis of miRNA profiling identified the six strongest miRNAs: miR-31-5p, miR-4286, miR-135-5p, miR-155-5p, miR-1-3p, and miR-145-5p. This research was examined the expression of  this miR in PSCC primary tumor (PT) and lymph node (LN) metastasis, and its role in carcinogenesis. Objective: To determine the different expressions of miR-31-5p, miR-4286, miR-135-5p, miR-155-5p, miR-1-3p, and miR-145-5p in PT and LN metastatic tumors compared with controls, as well as enrichment analysis in the carcinogenesis of PSCC. Methods: This study included 12 sample (4 PT, 4 LN MT, and 4 normal penile tissue from the resection edge as controls) from the same 4 patients. A t-test compared miR-31-5p, miR-4286, miR-135-5p, miR-155-5p, miR-1-3p, and miR-145-5p expressions between groups; with a p-value < 0>Results: All PSCC patients were all advanced stages, and had a 75% mortality rate. Novelty miRNAs discovered 107 significant and 81 in LN MT. MiR-31-5p, miR-4286, miR-135b-5p, and miR-155-5p were upregulated in PT and MT (p<0>Conclusion: Novel up-regulated miRNAs (miR-31-5p, miR-4286, miR-135-5p, miR-155-5p), and down-regulated (miR-145-5p, miR-1-3) are found in ethnic Balinese PSCC patient’s PT and LN MT. The strongest indicators for PSCC LN metastases are miR31-5p and miR-1-3p. This miRNA panel can be used as a canditate to support the development of diagnostic biomarkers, personalized therapeutic targets, an the diagnosis and prognosis of penile cancer.

Kata Kunci : miRNA, metastasis KGB, Karsinoma Sel Skuamosa Penis