Keanekaragaman Genetik Diaphorina citri Kuwayama (Hemiptera:Liviidae) dan Deteksi Bakteri Endosimbion Pada Sentra Produksi Jeruk di Indonesia

Uci Agustina, Alan Soffan, SP, M.Sc., Ph.D. ; Prof. Ir. Y. Andi Trisyono, M.Sc., Ph.D.

2023 | Tesis | S2 Ilmu Hama Tumbuhan

Asian citrus psyllid (ACP), Diaphorina citri Kuwayama (Hemiptera : Liviidae)  merupakan hama tanaman Rutaceae yang sangat merusak, terutama pada tanaman jeruk di  berbagai dunia karena menjadi agen penyebab penyakit Huanglongbing (HLB) melalui  aktivitasnya makan dengan menjadi vektor yang membawa bakteri Candidatus Liberibacter  asiaticus. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui kekerabatan dan keragaman genetik di  antara populasi D. citri pada sentra produksi Jeruk di Indonesia serta melakukan deteksi  secara molekuler bakteri endosimbion yang berasosiasi dengan D. citri menggunakan gen  target. Dalam penelitian ini, sofware MEGA digunakan untuk menggambarkan hubungan  filogenetik di antara semua populasi D. citri, sedangkan keragaman genetik dihitung dengan  DnaSP v6.  Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa meskipun D. citri berasal dari lokasi yang  berbeda, seperti Bengkulu yang geografisnya jauh dari Cianjur, keduanya memiliki  kekerabatan dekat. Hal yang menarik adalah, meskipun Bengkulu dan Cianjur memiliki  perbedaan signifikan dalam cuaca dan iklim, kekerabatan tetap terlihat. Temuan serupa  ditemukan pada D. citri asal Kalimantan dan D. citri wilayah Yogyakarta populasi  Laboratorium. Meskipun geografisnya tidak berdekatan, kekerabatan tetap terlihat. Selain  itu, D. citri asal Bengkulu, Yogyakarta populasi Lapangan, dan wilayah Bogor juga  terhubung ke D. citri asal Pakistan. Analisis haplotype menunjukkan tingginya keragaman  dengan nilai haplotype diversity (Hd) sebesar 0,94 dan nucleotide diversity sebesar 0,00405. Sementara itu, uji analisis keragaman haplotype pada D. citri asal US dan Asia menghasilkan keragaman sedang, dengan nilai masing-masing 0,53 dan 0,600. Secara keseluruhan, struktur populasi menunjukkan tingkat kekerabatan yang rendah antar kelompok tersebut. Informasi ini diharapkan dapat menjadi informasi awal yang digunakan  untuk mengembangkan pengendalian D. citri dengan memodifikasi bakteri-bakteri endosimbion yang terbukti menguntungkan D. citri.

The Asian citrus psyllid (ACP), Diaphorina citri Kuwayama (Hemiptera: Liviidae), is a  highly destructive pest of Rutaceae plants, particularly citrus crops worldwide, as it serves as a vector transmitting the bacterium Candidatus Liberibacter asiaticus and causing Huanglongbing (HLB) disease through its feeding activities. This research was conducted to elucidate the genetic  relatedness and diversity among D. citri populations in citrus production centers in Indonesia, as  well as to molecularly detect endosymbiotic bacteria associated with D. citri using a specific  gene target. The MEGA software was employed to illustrate the phylogenetic relationships  among all D. citri populations, while genetic diversity was calculated using DnaSP v6. The results of this research indicate that despite the diverse origins of D. citri, such as Bengkulu, which is geographically distant from Cianjur, they exhibit close kinship. Notably, despite significant differences in weather and climate between Bengkulu and Cianjur, their close kinship persists. Similar findings were observed between D. citri from Kalimantan and the Yogyakarta Laboratory population, despite their disparate geographical locations. Furthermore, D. citri from Bengkulu, the Yogyakarta Field population, and the Bogor region are also linked to  D. citri from Pakistan. Haplotype analysis reveals high diversity, with haplotype diversity (Hd) at 0.94 and nucleotide diversity at 0.00405. Meanwhile, the analysis of haplotype diversity in D. Citri from the US and Asia indicates moderate diversity, with values of 0.53 and 0.600, respectively. Overall, the population structure suggests a low level of relatedness among these groups. This information is expected to serve as preliminary data for developing D. citri control  strategies by modifying beneficial endosymbiotic bacteria associated with D. citri.

Kata Kunci : Diaphorina citri, Endosymbiont, Genetic Diversity, Haplotype, Phylogenetic.