DETEKSI GEN ANTIMICROBIAL RESISTANCE (AMR) PADA Ralstonia syzygii subsp. celebesensis PENYEBAB PENYAKIT DARAH PADA TANAMAN PISANG

Dea Putri Novitasari, Prof. Dr. Ir. Siti Subandiyah, M.Agr.Sc.

2023 | Skripsi | ILMU HAMA & PENYAKIT TUMBUHAN

Penyakit darah pada pisang merupakan penyakit penting bagi pertanaman pisang yang disebabkan oleh infeksi bakteri Ralstonia syzygii subsp. celebesensis (Rsc). Dalam proses budidaya dan pengelolaan OPT pada pertanaman pisang menggunakan pupuk dari ternak yang diberi antibiotik secara intensif dan pestisida kimia masih terus dilakukan. Kedua hal tersebut berpotensi sebagai penyebab terjadinya resistensi pada patogen dan bakteri lainnya. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh isolat bakteri Rsc dari tanaman pisang yang bergejala penyakit darah di PT. Great Giant Pinapple dan wilayah D. I. Yogyakarta serta untuk mendeteksi adanya gen antimicrobial resistance (AMR) pada Rsc penyebab penyakit darah pada tanaman pisang di PT Great Giant Pinapple dan wilayah D. I. Yogyakarta. Sampel dari wilayah D. I. Yogyakarta diambil dari kecamatan Banguntapan, kabupaten Bantul; kecamatan Jetis, kabupaten Bantul; kecamatan Depok, kabupaten Sleman; dan kecamatan Turi, kabupaten Sleman. Penelitian dilaksanakan dengan melakukan isolasi bakteri Rsc dari buah pisang yang bergejala penyakit darah, uji Gram bakteri, uji katalase, uji hipersensitif, uji patogenisitas, konfirmasi isolat secara molekuler dengan metode PCR menggunakan primer 121 F dan 121 R, serta deteksi gen AMR dengan metode PCR menggunakan primer yang didesain untuk mendeteksi gen AMR (gen aadA7, gen blaSFO, gen qepA, gen tetW, gen vanTC_2, gen ermX_2, gen blaVIM, gen mcr8, gen tet(X5), dan gen blaNDM5). Dari hasil penelitian diperoleh isolat bakteri yang memenuhi karakteristik dari Rsc penyebab penyakit darah pada pisang. Kemudian, dari hasil deteksi gen AMR diketahui bahwa pada isolat TBB, BTPb, BTPt, JTS, dan TRI terdeteksi adanya gen AMR dan isolat Rsc JTS telah mengalami multi drug resistance (MDR).

Blood disease of banana is an important disease for banana planting caused by infection of Ralstonia syzygii subsp. celebesensis (Rsc). In the process of cultivation and management of pests on banana plantations using fertilizers from livestock that are given intensive antibiotics and chemical pesticides are still carried out. Both of these have the potential to cause resistance to pathogens and other bacteria. This study aims to obtain Rsc bacterial isolates from banana plants with blood disease symptoms in PT. Great Giant Pinapple and region of D. I. Yogyakarta and to detect the presence of antimicrobial resistance (AMR) genes in Rsc causing blood disease of banana in PT Great Giant Pinapple and region of D. I. Yogyakarta. Sample from region of D. I. Yogyakarta is taken from Banguntapan district, Bantul regency; Jetis district, Bantul regency; Depok district, Sleman regency; and Turi district, Sleman regency. The study was conducted by isolating Rsc bacteria from bananas with blood disease symptoms, bacterial Gram test, catalase test, hypersensitivity test, pathogenicity test, molecular confirmation of isolates by PCR method using 121 F and 121 R primers, and detection of AMR genes by PCR method using primers designed to detect AMR genes (aada7 gene, blaSFO gene, qepA gene, tetW gene, vanTC_2 gene, ermX_2 gene, blaVIM gene, mcr8 gene, tet(X5) gene, and blaNDM5 gene). From the results obtained isolates of bacteria that meet the characteristics of Rsc causes blood disease of banana. Then, from the results of the detection of the AMR gene is known that in isolate TBB, BTPb, BTPt, JTS, and TRI detected the AMR gene and JTS isolates have experienced multi drug resistance (MDR).

Kata Kunci : Ralstonia syzygii subsp. celebesensis, penyakit darah pada tanaman pisang, gen AMR, multi drug resistance (MDR)