Keragaman Genetik dan Aktivitas Antijamur Streptomyces Asal Perakaran Tanaman Obat

SURYA DWI KUSUMA D, Dr. Ir. Jaka Widada, M.P.; M. Saifur Rohman, S.P., M.Eng., Ph.D.

2012 | Skripsi | S1 MIKROBIOLOGI PERTANIAN

Streptomyces yang diisolasi dari perakaran tanaman obat mungkin memiliki potensi besar dalam menghasilkan senyawa-senyawa bioaktif. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui keragaman genetik dan aktivitas antijamur 6 Streptomyces yang diisolasi dari rizosfer berbagai tanaman obat. Keragaman genetik dianalisis menggunakan Rep-PCR dengan primer BOX A1R, 16S rDNA-RFLP, dan NRPS-RFLP. Aktivitas antijamur dianalisis dengan menggunakan Colletothricum capsici sebagai jamur indikator. Keragaman genetik keenam Streptomyces terbagi menjadi 5 kelompok berdasarkan Rep-PCR, 3 kelompok berdasarkan 16S rDNA-RFLP, dan 2 kelompok berdasarkan NRPS-RFLP. Ada 4 Streptomyces yang memiliki aktivitas antijamur dan hasil ini berkorelasi dengan keragaman gen NRPS.

Streptomyces which isolated from medicinal plant rhizosphere may have a great potential to produce bioactive compounds. This research was conducted to determine genetic and antifungal activity of six Streptomyces isolated from medicinal plant rhizosphere. Genetic diversity was analyzed using Rep-PCR with BOX A1R primer, 16S rDNA-RFLP, and NRPS-RFLP. Antifungal activity was analyzed using Colletothricum capsici as an indicator fungal. Genetic diversity of six Streptomyces divided into 5 groups based on Rep-PCR method, 3 groups based on 16S rDNA-RFLP, and 2 groups based on NRPS-RFLP. There are 4 Streptomyces which have antifungal activity and the result was correlated to NRPS gene diversity.

Kata Kunci : keragaman, Streptomyces, RFLP, gen NRPS